在集体土地征收未签补充协议的情况下，被告的确定需根据具体情形来判断，以下是几种可能的情况及对应的被告确定方式：
若征收行为由县级以上人民政府直接实施：
- 被告为县级以上人民政府。根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，县级以上人民政府是土地征收的主体，负责组织实施土地征收工作。若未签订补充协议且存在争议，通常应以实施征收行为的县级以上人民政府为被告。
若征收行为由县级以上人民政府授权或委托的部门、机构实施：
- 被告可能为被授权或委托的部门、机构，也可能为县级以上人民政府。这取决于授权或委托的具体内容以及法律、法规的规定。若被授权或委托的部门、机构在授权范围内实施征收行为，且其行为具有独立性，那么被告可能为该部门或机构。但若其行为超出授权范围或存在其他违法情形，且县级以上人民政府对此负有责任，那么被告可能仍为县级以上人民政府。
若存在多个主体共同实施征收行为：
- 被告为共同实施征收行为的多个主体。在集体土地征收过程中，可能存在多个部门或机构共同参与实施征收行为的情况。若未签订补充协议且存在争议，且这些部门或机构的行为均与争议有关，那么它们应作为共同被告。
法律背景与建议：
- 法律背景：集体土地征收涉及农民的切身利益，必须依法进行。在征收过程中，应签订征收补偿协议，明确双方的权利和义务。若未签订补充协议或协议内容存在争议，农民有权通过法律途径维护自己的合法权益。
- 建议：
- 在面临集体土地征收未签补充协议的情况时，首先应收集相关证据，如征收通知、补偿方案、现场照片等，以证明自己的权益受到侵害。
- 尝试与征收方进行协商，寻求达成补充协议或解决争议的方式。若协商无果，可考虑通过行政复议或行政诉讼等法律途径来维护自己的权益。
- 在选择法律途径时，建议咨询专业律师，以了解具体的法律程序和可能的风险，从而做出更明智的决策。
可能法律后果：
- 若农民通过法律途径成功维护了自己的权益，征收方可能需要承担相应的法律责任，如支付补偿款、赔偿损失等。
- 若农民未能在法定期限内提起行政复议或行政诉讼，或未能提供充分的证据证明自己的权益受到侵害，那么可能面临败诉的风险，从而无法获得相应的补偿或赔偿。
总结：在集体土地征收未签补充协议的情况下，被告的确定需根据具体情形来判断。农民在面临此类情况时，应积极收集证据，尝试与征收方协商，并在必要时寻求法律途径来维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。