经济补偿金的计算通常是按照劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的应发工资的平均值来确定，而非合同工资或实发工资。以下是对这一问题的详细分析：
一、应发工资与实发工资、合同工资的区别
- 应发工资：指员工根据工作性质和合同约定应获得的工资总额，是员工劳动所得的完整报酬，涵盖基本工资、岗位工资、绩效工资、奖金、津贴等所有收入形式。
- 实发工资：为员工实际到手的工资金额，它在应发工资的基础上扣除了个人所得税、社保公积金个人缴纳部分等费用，因此通常低于应发工资。
- 合同工资：指劳动合同中约定的工资数额，它可能并不完全反映劳动者的实际收入情况，特别是当存在奖金、津贴等变动收入时。
二、经济补偿金的计算依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条及《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条的规定，经济补偿金的计算依据是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，且此月工资应按照劳动者应得工资（即应发工资）计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
三、不同情形的具体分析
正常情况：
- 经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资指的是劳动合同解除或终止前十二个月的应发工资的平均值。
高工资情况限制：
- 若劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付。
- 向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
特殊情况处理：
- 如果劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资低于当地最低工资标准，经济补偿金将按照当地最低工资标准来计算。
- 实际工资难以确定时，可能会参照合同工资，但这种情况较少见，且需确保合同工资不违反法律法规强制性规定。
四、实际操作注意事项
- 在计算经济补偿金时，务必确保使用的是应发工资，即包含所有货币性收入（如基本工资、绩效工资、奖金、津贴等）的总额。
- 劳动者应了解自己的权益，确保在面临劳动合同解除或终止时能够获得与其实际贡献和应得收入相符的经济补偿。
示例说明：
假设某劳动者在劳动合同解除前十二个月的应发工资总额为120,000元，则其月平均工资为10,000元。若该劳动者在本单位工作满5年，则其应获得的经济补偿金为5个月工资，即50,000元。若该劳动者的月工资高于当地职工月平均工资的三倍，则经济补偿金的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
综上所述，经济补偿金的计算主要基于应发工资，但在特定情形下也可能考虑实际工资或合同工资。劳动者和用人单位在处理相关事宜时，应仔细审查法律规定和合同条款，确保合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。