药品上市许可注册过程中发生侵权，惩罚力度较大，具体需根据侵权类型和情节严重程度判断。以下从不同侵权类型和情节角度详细说明：

1. 专利侵权
   若在药品上市许可注册过程中，未经专利权人许可实施其专利（如制造、使用、销售等），可能面临民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。根据《专利法》第六十五条，侵权赔偿数额按照权利人因被侵权所受到的实际损失或侵权人因侵权所获得的利益确定；若难以确定，可参照专利许可使用费的倍数合理确定。若侵权情节严重（如多次侵权、造成重大损失），可能被处以更高额赔偿，甚至构成《刑法》第二百一十六条规定的“假冒专利罪”，最高可处三年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金。

2. 商标侵权
   若在药品包装、说明书或宣传中使用与他人注册商标相同或近似的标识，可能构成商标侵权。根据《商标法》第六十条，侵权人可能面临停止侵权、没收违法所得、罚款（违法经营额五倍以下或二十五万元以下）等行政处罚；若情节严重（如造成重大影响或损失），可能构成《刑法》第二百一十三条规定的“假冒注册商标罪”，最高可处七年有期徒刑，并处罚金。

3. 商业秘密侵权
   若在药品研发或注册过程中，通过不正当手段获取、使用或披露他人商业秘密（如未公开的配方、工艺等），可能构成商业秘密侵权。根据《反不正当竞争法》第十七条，侵权人需承担民事赔偿责任，赔偿数额可能包括权利人因被侵权所受到的实际损失或侵权人因侵权所获得的利益；若难以确定，可由法院根据侵权情节判决一定数额的赔偿。若情节严重（如造成重大损失或恶劣影响），可能构成《刑法》第二百一十九条规定的“侵犯商业秘密罪”，最高可处十年有期徒刑，并处罚金。

4. 行政处罚与信用惩戒
   除上述民事和刑事责任外，侵权行为还可能面临药品监管部门的行政处罚，如警告、罚款、没收违法所得、责令停产停业、吊销许可证等。此外，侵权行为可能被记入信用记录，影响企业或个人的市场信誉和后续经营。

建议：药品上市许可注册过程中，企业应严格遵守知识产权法律法规，加强内部合规管理，避免侵权风险。若发现侵权行为，应及时采取措施（如停止侵权、协商赔偿、提起诉讼等）以降低损失。如有具体法律问题，可直接向我咨询。