您有权对责任认定书提出申诉，即使对方电动车被认定为非机动车。以下是对此问题的详细分析：

一、申诉权利的基础

在交通事故责任认定过程中，无论涉事车辆是机动车还是非机动车，事故双方都有权对责任认定书提出异议并申请复核。这是基于《道路交通事故处理程序规定》的相关规定，该规定明确了事故当事人对责任认定不服时的救济途径。

二、超标电动车的认定与影响

1. 超标电动车的认定：超标电动车通常指的是那些速度、重量等参数超过国家标准的电动车。这类车辆在法律上可能被视为机动车，尽管它们可能并未按照机动车进行登记和管理。然而，如果责任认定书已经明确将对方电动车认定为非机动车，那么这一认定将成为后续处理的基础。

2. 对责任认定的影响：电动车是否被认定为机动车或非机动车，会影响事故责任的划分。但无论认定结果如何，您都有权对责任认定书提出申诉。如果您认为责任认定存在错误或不合理之处，比如对方电动车实际上属于机动车范畴却未被认定，或者责任划分比例不公正等，都可以通过申诉来寻求更公正的处理结果。

三、申诉的流程与注意事项

1. 申诉流程：

   • 提交申请：在收到责任认定书后的一定期限内（通常是三日内），向作出责任认定的公安机关交通管理部门提出书面复核申请。
   • 复核审查：公安机关交通管理部门会受理复核申请，并重新审查事故证据、事实认定和责任划分等。
   • 复核结论：复核机关会作出维持原责任认定、撤销原责任认定并责令重新认定或者直接作出新的责任认定等结论。

2. 注意事项：

   • 及时提出：务必在规定的期限内提出复核申请，逾期将可能丧失复核权利。
   • 准备充分：在提出复核申请时，应准备充分的证据和理由来支持自己的观点，比如事故现场照片、视频、证人证言等。
   • 理性表达：在申诉过程中，应保持理性、客观的态度，避免情绪化或攻击性的言论。

四、可能的法律后果

如果复核申请成功，原责任认定书可能会被撤销或修改，从而影响事故的最终处理结果。这可能包括赔偿责任的重新划分、行政处罚的调整等。因此，申诉是一个值得尝试的救济途径，但也需要做好充分的准备和应对可能的结果。

如果您对责任认定书有异议，不妨积极行使自己的申诉权利。在申诉过程中，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。