在处理医疗纠纷案件时，若已经进行了医疗事故责任认定，并且后续的司法鉴定结果与医疗事故责任认定结果存在不一致，特别是当司法鉴定结果显示没有责任时，法院的判决会综合多方面因素进行考量。以下是对这一问题的详细解答：
一、医疗事故责任认定与司法鉴定的关系
医疗事故责任认定：通常由医学会或相关医疗鉴定机构进行，主要依据医疗规范、诊疗常规以及患者的具体情况，对医疗机构及其医务人员在医疗活动中是否存在过错，以及过错与患者损害后果之间的因果关系进行认定。
司法鉴定：在医疗纠纷案件中，司法鉴定可能涉及医疗过错鉴定、因果关系鉴定等，其目的在于为法院提供更为客观、专业的证据支持。司法鉴定结果往往被视为重要的参考依据，但并非绝对。
二、法院判决的考量因素
证据的充分性与可信度：法院会综合审查医疗事故责任认定报告和司法鉴定报告，评估两者的证据充分性、可信度以及是否存在矛盾或不合理之处。
法律适用与责任划分：根据《医疗事故处理条例》、《侵权责任法》等相关法律法规，法院会判断医疗机构及其医务人员是否存在过错，以及过错与患者损害后果之间的因果关系，进而划分责任比例。
案件具体情况：法院还会考虑患者的病情、治疗过程、医疗机构及其医务人员的行为表现等具体情况，以及这些因素对损害后果的影响程度。
三、司法鉴定无责任时的法院判决
若司法鉴定结果确实无责任：且该结果得到法院的认可，那么法院在判决时可能会倾向于认定医疗机构及其医务人员不承担赔偿责任。但这一结论并非绝对，因为法院还会综合考虑其他证据和案件具体情况。
若存在其他证据支持医疗机构有过错：即使司法鉴定结果显示无责任，但如果存在其他证据（如医疗事故责任认定报告、专家证人证言等）表明医疗机构及其医务人员存在过错，且该过错与患者损害后果之间存在因果关系，那么法院仍可能判决医疗机构承担一定的赔偿责任。
责任比例的调整：在综合考量各种因素后，法院可能会根据实际情况对责任比例进行调整。例如，如果医疗机构及其医务人员的过错行为对损害后果的影响较小，那么法院可能会降低其责任比例；反之，则可能提高其责任比例。
四、实际案例参考
以您提供的案例为例，虽然市医学会做出了医疗事故技术鉴定，认定医方承担次要责任，但后续的司法鉴定结果可能并未完全支持这一结论。在这种情况下，法院会综合审查两份鉴定报告以及其他相关证据，最终根据法律适用和案件具体情况做出判决。如果司法鉴定结果确实无责任，且得到法院的认可，那么法院可能会判决医疗机构不承担赔偿责任或承担较低比例的赔偿责任。
五、建议
对于涉及医疗纠纷的案件，建议当事人及时咨询专业律师，了解相关法律法规和诉讼程序，以便更好地维护自己的合法权益。同时，医疗机构及其医务人员也应加强医疗质量管理，提高医疗技术水平，减少医疗纠纷的发生。
综上所述，当医疗事故责任认定与司法鉴定结果不一致时，法院会综合考量各种因素做出判决。因此，在处理此类案件时，应充分准备证据材料，并咨询专业律师以获取更为准确和全面的法律建议。