员工骑三轮逆行导致车祸的赔偿问题，需根据具体情况分情况讨论，核心结论如下：

1. 员工是否属于职务行为
   若员工骑三轮是执行工作任务（如送货、搬运等），根据《民法典》第1191条，用人单位需承担替代赔偿责任，即先向受害方赔偿，后续可向员工追偿（若员工存在故意或重大过失）。
   关键点：需证明“逆行行为与职务的关联性”，例如是否因赶时间、工作指令等导致逆行。

2. 员工非职务行为的责任
   若员工逆行是个人行为（如下班途中、私事外出），则由员工自行承担全部责任，包括赔偿对方医疗费、车辆损失等。若员工受伤，可能无法认定为工伤（需符合《工伤保险条例》中“上下班途中非本人主要责任”的条件）。

3. 责任划分与赔偿比例
   即使员工逆行，若对方存在过错（如超速、未避让），可能按过错比例分担责任。例如，员工逆行负70%责任，对方负30%，则赔偿按此比例计算。
   提示：需通过交警出具的《交通事故责任认定书》确定责任比例。

4. 用人单位的连带风险
   若用人单位未提供安全培训、未强制佩戴头盔，或三轮车存在安全隐患（如制动失灵），可能因未尽到安全保障义务承担部分赔偿责任。

行动建议：

• 立即报警并保留事故认定书；
  
• 收集证据（如行车记录仪、证人证言）；
  
• 区分职务/个人行为，明确责任主体；
  
• 协商不成时，通过诉讼解决，注意3年诉讼时效。
  

如有进一步细节（如是否签订劳动合同、车辆归属等），可向我补充说明，我会为您细化分析。