结论：拼多多上销售同一种成份的农药但收到两个不同包装的情况，是否合法需分情况讨论，主要取决于销售行为是否符合相关法律法规的规定，特别是关于农药销售、包装标识以及消费者权益保护等方面的规定。
分析：
农药销售与包装标识的合法性：
- 根据《农药管理条例》等相关法律法规，农药的销售必须遵守严格的规定，包括农药的登记、生产、经营、使用以及包装、标签等。农药的包装应当符合国家有关规定，易于识别和防止误用，且必须标注农药名称、剂型、有效成分及其含量、毒性及其标识、使用范围、使用方法和剂量、使用技术要求和注意事项、生产日期及批号、有效期、净含量、企业名称及其联系方式等信息。
- 如果拼多多上销售的同一种成份的农药，其两个不同包装均符合上述法律法规的要求，且包装上的信息真实、准确、完整，那么这种销售行为在包装标识方面是合法的。
消费者权益保护的角度：
- 从消费者权益保护的角度来看，销售者有义务向消费者提供真实、准确、完整的商品信息，包括商品的成分、功效、使用方法、注意事项等。如果销售者故意隐瞒或误导消费者，导致消费者因误解而购买了不符合其需求的商品，那么销售者的行为可能构成欺诈或误导消费者，从而违反了《消费者权益保护法》等相关法律法规。
- 在拼多多上销售同一种成份的农药但收到两个不同包装的情况下，如果销售者未明确告知消费者这两个包装之间的区别（如包装材料、设计、容量等非核心成份相关的差异），或者故意误导消费者认为这两个包装代表不同成份或功效的农药，那么销售者的行为可能侵犯了消费者的知情权，构成不合法行为。
平台责任与监管：
- 拼多多作为电商平台，有责任对平台上的商品进行监管，确保销售的商品符合相关法律法规的要求。如果拼多多未能履行其监管职责，导致平台上存在销售不合规农药的行为，那么拼多多也可能需要承担相应的法律责任。
建议：
- 对于消费者而言，在购买农药时，应仔细查看包装上的信息，确保购买的农药符合自己的需求，并保留好购买凭证和包装，以便在出现问题时维权。
- 对于销售者而言，应严格遵守相关法律法规的规定，确保销售的农药包装标识真实、准确、完整，并明确告知消费者商品的相关信息，避免误导消费者。
- 对于拼多多等电商平台而言，应加强对平台上商品的监管力度，确保销售的商品符合相关法律法规的要求，维护消费者的合法权益。
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