夜间驾驶营运大客车超时5分钟，通常属于疲劳驾驶的范畴，将面临罚款和记分的处罚。具体分析如下：

1. 法律依据与处罚标准
   根据《道路交通安全法实施条例》第六十二条第七项及《道路交通安全违法行为记分管理办法》第九条第七项规定，连续驾驶营运机动车超过4小时未停车休息，或停车休息时间少于20分钟的，属于疲劳驾驶。虽然超时5分钟看似短暂，但已构成违法行为，通常会被处以罚款200元，并记9分。

2. 执法实践中的考量因素

   • 超时时长：5分钟虽短，但法律对疲劳驾驶的认定以“是否满足休息时间”为核心，而非超时幅度。即使仅超时1分钟，只要未达到20分钟休息要求，即构成违法。
     
   • 证据固定：交警可能通过行车记录仪、GPS轨迹、高速收费站记录等证据，核实驾驶时间及休息情况。若证据充分，处罚难以避免。
     
   • 情节轻重：若超时5分钟系因突发情况（如寻找休息区困难），且驾驶员能提供合理说明，可能酌情减轻处罚，但法律上仍构成违法。

3. 特殊情形提示

   • 夜间驾驶的加重责任：夜间视线差、反应时间延长，疲劳驾驶风险更高。若超时行为发生在夜间，执法部门可能从严认定，但处罚标准与白天一致。
     
   • 企业连带责任：若车辆所属企业未落实动态监控职责，未提醒驾驶员休息，可能面临交通运输部门的行政处罚（如罚款、停业整顿等）。

建议：营运大客车驾驶员应严格遵守“每4小时休息20分钟”的规定，可通过设置闹钟、使用导航软件的休息提醒功能等方式避免疏忽。若已因超时被处罚，可核对执法文书中的违法时间、地点等证据，确保处罚合法合规。如有疑问，可直接向我咨询具体案件处理流程。