结论前置：公司注销后，劳动者在特定情况下依然可以申请劳动仲裁以维护自身合法权益，但需根据具体情况确定被申请人并准备相应证据。

一、可以申请劳动仲裁的情况及被申请人确定

1. 公司注销前未依法清算

   • 法律依据：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第十九条，若公司未经依法清算即办理法人注销登记，有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人需对公司债务承担相应赔偿责任。
   • 被申请人确定：劳动者可将这些主体（股东、董事、控股股东、实际控制人）列为被申请人申请劳动仲裁，要求其支付未清偿的工资、经济补偿金等劳动债权。

2. 清算组成员存在过错

   • 法律依据：同样依据上述规定第二十三条，清算组成员在清算过程中违反法律、行政法规或公司章程给公司或债权人造成损失的，应承担赔偿责任。
   • 被申请人确定：劳动者可以清算组成员为被申请人，要求其赔偿因过错导致的损失，如未依法通知劳动者申报债权等。

3. 有承继主体

   • 情况说明：若公司注销后有承继其权利义务的主体（如合并、分立后的公司），劳动者可将该承继主体列为被申请人申请劳动仲裁。
   • 示例：若公司A与公司B合并后注销，劳动者可向合并后的新公司申请劳动仲裁。

4. 劳动争议诉讼期间公司恶意注销

   • 处理方式：在劳动争议诉讼期间，若公司恶意注销以逃避债务，劳动者可变更诉讼对象，向相关主体或个人进行维权，如向股东、清算组成员等追责。

二、不可以申请劳动仲裁的情况

• 公司已依法清算并注销：若公司在注销前已依法进行清算，并足额支付了员工工资、经济补偿金等各项费用，员工的劳动债权已得到妥善处理，此时员工再申请劳动仲裁将缺乏事实和法律依据，一般不会得到支持。

三、申请劳动仲裁需准备的特殊证明材料及流程

1. 特殊证明材料

   • 劳动关系证明：劳动合同、工资支付记录、工作证、考勤记录、加班通知、通讯记录、同事见证等，以证明劳动者与原公司存在劳动关系。
   • 公司注销相关证明：公司注销登记证明、清算报告（如有）、股东会决议（如有）等，以证明公司已注销及注销前的清算情况。
   • 权益受损证明：如未支付的工资单、经济补偿金计算依据、社保未缴纳证明等，以证明劳动者的劳动权益受损。

2. 申请流程

   • 确定被申请人：根据公司注销的具体情况，确定合适的被申请人，如股东、清算义务人、清算组成员、承继主体等。
   • 准备申请材料：包括《劳动仲裁申请书》、身份证明材料、劳动关系证明文件及证据材料等。
   • 提交申请：向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提交申请，并按照要求填写申请表和提交相关材料。
   • 等待受理与裁决：劳动争议仲裁委员会将依法对申请进行审查，并在受理后进行调解或裁决。

四、法律依据与注意事项

• 法律依据：主要依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》、《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》等相关法律法规。
• 注意事项：
  • 仲裁时效：劳动者应在劳动争议发生后的一年内（具体时效可能因地区而异）提出仲裁申请，超过时效的可能不被受理。
  • 证据准备：劳动者需准备充分的证据来支持自己的诉求，确保证据的合法性、真实性和关联性。
  • 专业咨询：由于公司注销后申请劳动仲裁涉及复杂的法律关系和证据收集，建议劳动者在申请前向我咨询，以获取更具体的法律建议。

综上所述，公司注销后劳动者仍然可以申请劳动仲裁，但关键在于明确责任主体、准备充分证据并在规定时效内提出申请。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。