结论：因拿触鱼器被拘留三天，一般情况下不会留下案底，但如果是因触犯刑法而被刑事拘留，且后续被法院判决有罪，则会留下案底。

分析说明：

1. 行政拘留与案底的关系：

   • 如果因拿触鱼器（假设为非法捕捞工具）违反了《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关行政法规，而被公安机关处以行政拘留三天，这种拘留属于行政处罚，不会留下案底。行政拘留的记录通常只会在公安机关内部留存，不会对外公开，也不会影响个人的社会信用或就业等。

2. 刑事拘留与案底的关系：

   • 如果因拿触鱼器（在特定情境下，如使用禁用工具或方法捕捞，且情节严重）触犯了《中华人民共和国刑法》中关于非法捕捞水产品罪等相关条款，而被公安机关刑事拘留，且后续被法院判决有罪，那么就会留下案底。刑事拘留是刑事诉讼过程中的一种强制措施，如果最终被法院判决有罪，该记录将会成为个人犯罪记录的一部分，对个人的社会信用、就业、出国等可能产生不利影响。

特殊场景：

• 在某些情况下，即使最初是行政拘留，但如果后续发现行为构成犯罪，也可能转为刑事拘留，并最终留下案底。例如，如果在使用触鱼器捕捞时，不仅违反了行政法规，还涉及到了非法捕捞水产品罪等刑事犯罪，且情节严重，那么公安机关在初步调查后可能会将案件升级为刑事案件，进行刑事拘留，并最终由法院进行审判。

后续建议：

• 如果您因拿触鱼器被拘留三天，且不确定是行政拘留还是刑事拘留，建议您向拘留您的公安机关咨询，了解具体的拘留性质和原因。
• 如果您担心可能留下案底，或者已经因类似行为受到过行政处罚，建议您今后严格遵守相关法律法规，避免再次触犯法律，以免给自己带来不必要的麻烦。

法律背景：

• 《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关行政法规规定了对于非法捕捞等行为的行政处罚措施。
• 《中华人民共和国刑法》中关于非法捕捞水产品罪等相关条款规定了对于严重非法捕捞行为的刑事处罚措施。

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