若资质审查不通过但合同已签订，需分情况处理履约问题，核心结论如下：

1. 若资质审查不通过系因自身原因（如资质造假、条件不符）

   • 合同效力风险：根据《民法典》第143条，若资质系合同生效要件（如建筑资质、行业许可），因自身原因不通过可能导致合同无效或部分条款无效，需立即与对方协商解除合同或调整履约方式，避免扩大损失。
     
   • 违约责任承担：若合同明确约定“资质通过为履约前提”，未通过可能构成根本违约，需按约定赔偿对方损失（如已支付的预付款、预期利益等）；若未约定，需根据实际损失承担过错责任。
     
   • 补救措施：尽快补办资质（如申请临时许可、升级资质等级），或与对方协商由第三方代为履行（需对方书面同意），争取继续履行合同。
     

2. 若资质审查不通过系因对方原因（如审查标准错误、程序违法）

   • 合同效力不受影响：若自身资质真实有效，但对方审查程序违法（如未公示审查标准、超期未反馈），可依据《民法典》第527条主张“不安抗辩权”，暂停履行并要求对方提供担保或纠正审查行为。
     
   • 行政救济途径：若对方为行政机关（如招投标审查），可依据《行政许可法》第7条申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销错误审查结果，恢复合同履行资格。
     
   • 民事索赔权利：若对方审查过错导致己方损失（如错过其他商机），可要求对方赔偿直接损失（如差旅费、鉴定费）及合理间接损失（如预期利润，需举证证明）。
     

3. 若资质审查不通过系因不可抗力或情势变更（如政策突变、行业整顿）

   • 协商变更合同：根据《民法典》第533条，若资质要求因政策调整无法实现（如环保标准提高），双方可协商变更合同内容（如延长履约期限、降低资质标准）或解除合同，互不承担违约责任。
     
   • 公平分担损失：若合同因情势变更解除，双方需按公平原则分担已发生的费用（如已采购的原材料、已支付的定金），避免一方独担损失。
     

行动建议：

• 立即核查资质审查不通过的具体原因（自身条件、对方程序、政策变化），收集相关证据（如审查通知、资质证书、沟通记录）；
  
• 根据原因选择上述对应策略，优先通过协商解决，协商不成可依据合同争议解决条款（仲裁或诉讼）维权；
  
• 若涉及重大合同（如工程承包、技术合作），建议同步咨询专业律师，制定风险防控方案。
  

如有具体合同条款或审查文件，可进一步向我提供，我会结合细节为您分析履约路径。