核心结论：车贷逾期53天被扣5000多元，能否找回需分情况讨论，主要取决于扣款性质（违约金、罚息、其他费用）及合同约定是否合法合理。以下是具体分析：

1. 先确认扣款性质：违约金、罚息还是其他费用？

• 违约金：若合同约定“逾期需支付违约金”，需核对违约金比例是否超过法律上限（根据《民法典》第585条，违约金过高可请求法院或仲裁机构调整，通常不超过实际损失的30%）。若5000元远超贷款本金或利息的合理比例（如贷款本金仅几万元，违约金5000元可能过高），可主张调整。
• 罚息：若合同约定“逾期按日计收罚息”，需核对罚息利率是否超过法定上限（根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的的规定》，民间借贷利率上限为LPR的4倍，车贷虽不属民间借贷，但金融机构罚息也应合理，若明显过高可协商或诉讼调整）。
• 其他费用：如催收费、律师费等，需核对合同是否明确约定且费用合理。若未约定或费用虚高（如未实际产生律师费却扣款），可要求返还。

2. 核对合同条款：扣款是否有明确依据？

• 翻看车贷合同中“违约责任”“费用承担”等条款，确认扣款项目、计算方式是否与合同一致。若合同未明确约定或条款模糊（如仅写“逾期需承担一切费用”），可主张扣款无效。
• 关键点：若合同条款显失公平（如单方面加重借款人责任、排除借款人权利），可依据《民法典》第497条主张条款无效，要求返还部分费用。

3. 行动建议：分步骤处理

• 第一步：联系贷款方
  要求对方提供扣款明细（包括每项费用的计算依据、合同条款引用），并书面说明扣款理由。若对方拒绝或解释不清，可进一步采取措施。
• 第二步：协商或投诉
  若扣款明显不合理，可先与贷款方协商退还部分费用；若协商无果，可向当地银保监会（针对银行/汽车金融公司）或地方金融监管局投诉，要求介入调查。
• 第三步：诉讼或仲裁
  若投诉无果，可向法院起诉或依据合同约定申请仲裁，主张扣款无效或调整金额。需准备证据：合同、扣款记录、沟通记录等。

4. 风险提示：逾期可能影响征信

• 除扣款问题外，逾期53天可能已影响个人征信记录。建议尽快还清欠款，并要求贷款方更新征信信息（若已还清）。若因扣款争议导致逾期，可向征信机构提出异议申请。

总结：能否找回5000多元，需结合扣款性质、合同约定及法律规定综合判断。建议先核对合同、要求贷款方说明依据，再通过协商、投诉或诉讼途径解决。若有具体合同条款或扣款明细，可进一步向我咨询，我会帮您分析合理性。