结论：在土地承包权流转中，若第二承包商违反合同，第三方（即原承包商或设施所有者）能否要回设施，需根据合同约定、设施性质及违约情形综合判断。以下从不同角度分析：

1. 合同约定优先：设施归属与违约责任

• 若合同明确约定设施归属：例如，合同中写明“设施所有权归第三方，第二承包商仅享有使用权”，则第二承包商违约时，第三方有权依据合同要求返还设施。此时，违约责任可能包括返还设施、赔偿损失等。
• 若合同未明确约定：需进一步分析设施性质（如是否为添附物、是否可分割）及违约情形（如根本违约还是一般违约）。若设施已与土地形成不可分割的添附（如固定灌溉设备），第三方可能需通过赔偿损失而非直接取回设施的方式主张权利。

2. 设施性质：添附与所有权保留

• 添附情形：根据《民法典》第三百二十二条，若设施因附着于土地而成为土地组成部分（如永久性建筑），且无法分离或分离会显著降低价值，第三方可能需通过协商或诉讼主张补偿，而非直接取回设施。
• 所有权保留情形：若设施为独立可移动物（如农机具），且合同明确约定所有权归第三方，则第三方有权要求返还。例如，合同中写明“农机具所有权不随承包权流转”，则第二承包商违约时，第三方可直接取回。

3. 违约情形：根本违约与救济方式

• 根本违约：若第二承包商的行为导致合同目的无法实现（如擅自转包、破坏土地），第三方可依据《民法典》第五百六十三条解除合同，并要求返还设施或赔偿损失。
• 一般违约：若违约行为未导致合同目的落空（如未按时支付费用），第三方可能需先催告履行，若仍不履行，再主张解除合同及返还设施。

4. 实务建议：证据收集与程序选择

• 证据收集：保留合同、设施购置发票、违约证据（如照片、证人证言）等，以证明设施所有权及违约事实。
• 程序选择：优先通过协商解决；协商不成，可向农村土地承包仲裁委员会申请仲裁，或直接向法院起诉。若涉及设施价值较高，建议同步申请财产保全，防止设施被转移或损毁。

5. 特殊情形：设施与土地承包权的关联性

• 设施为承包权必要条件：若设施是开展承包经营的必要条件（如温室大棚），且合同约定“设施随承包权流转”，则第三方可能无法直接取回，但可主张违约赔偿。
• 设施为第三方独立投资：若设施由第三方独立投资建设，且合同明确约定“承包权终止时设施归第三方”，则第三方有权要求返还。

总结：第三方能否要回设施，需结合合同约定、设施性质及违约情形综合判断。建议先审查合同条款，明确设施归属及违约责任；若合同无明确约定，再根据设施是否为添附物、违约是否导致合同目的落空等因素，选择协商、仲裁或诉讼途径主张权利。如有具体合同或证据材料，可进一步向我咨询，以便更精准分析。