刑事案件立案之后，双方在特定情况下是可以进行调解的，但并非所有刑事案件都适用调解。以下是对这一问题的详细分析：
一、调解的适用范围
自诉案件：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于告诉才处理的案件（如侮辱、诽谤案，暴力干涉婚姻自由案，虐待案等）以及被害人有证据证明的轻微刑事案件，双方当事人可以自行和解。这类案件通常涉及个人权益，且情节相对较轻，因此法律允许双方通过调解解决纠纷。
公诉案件中的特定情形：
- 在公诉案件中，虽然主要由检察机关代表国家提起公诉，但在某些特定情况下，如犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人也可以和解。这通常适用于因民间纠纷引起，涉嫌刑法分则第四章、第五章规定的犯罪案件，且可能判处三年有期徒刑以下刑罚的，或者除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件。
二、调解的法律后果
自诉案件：
- 在自诉案件中，如果双方达成和解，自诉人可以撤回自诉，从而终结刑事诉讼程序。这意味着犯罪嫌疑人或被告人将不再面临刑事追究。
公诉案件：
- 在公诉案件中，双方达成和解后，公安机关可以向人民检察院提出从宽处理的建议。人民检察院也可以向人民法院提出从宽处罚的建议；对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，可以作出不起诉的决定。人民法院在审理案件时，也可以依法对被告人从宽处罚。这体现了法律对和解的积极态度，旨在促进社会和谐与修复被破坏的社会关系。
三、调解的限制与注意事项
调解的自愿性：
- 调解必须基于双方当事人的自愿原则进行。任何一方都不得强迫对方接受调解或达成和解协议。这是保障当事人合法权益的重要前提。
调解的合法性：
- 调解协议的内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定或损害国家、集体、第三人的利益。否则，调解协议将无效或被撤销。
调解的局限性：
- 并非所有刑事案件都适用调解。对于严重危害社会治安的犯罪案件（如故意杀人、抢劫、强奸等），法律通常不允许调解或和解。这是为了维护社会秩序和公共安全。
总结来看，刑事案件立案之后双方在特定情况下是可以进行调解的，但调解的适用范围、法律后果以及限制与注意事项都需要严格遵循法律规定。如果您或您身边的人涉及刑事案件并希望了解调解的相关事宜，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。