面对非法改装电动车商家拒不承认的情况，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
收集证据：
- 改装前后的对比照片或视频：这些证据能够直观地展示电动车的改装情况，是证明商家非法改装行为的关键。
- 购买凭证和改装记录：保留好购买电动车的发票、收据以及任何与改装相关的记录，如改装合同、改装部件的购买凭证等。
- 证人证言：如果有目击者或了解改装情况的人，可以请他们提供证言，以支持你的主张。
与商家协商：
- 在收集到足够证据后，你可以尝试与商家进行协商，要求其承认改装行为并承担相应的责任，如退货、换货、赔偿等。
- 协商时，保持冷静和理性，明确表达自己的诉求和依据，避免情绪化或过激的言行。
向相关部门投诉：
- 如果商家拒不承认且协商无果，你可以向当地的市场监管部门或消费者协会投诉，寻求他们的帮助和支持。
- 投诉时，提供详细的证据和情况说明，以便相关部门能够准确了解事情经过并作出处理。
考虑法律途径：
- 提起民事诉讼：如果商家的行为给你造成了经济损失或人身伤害，你可以考虑向法院提起民事诉讼，要求商家承担赔偿责任。在诉讼过程中，你需要提供充分的证据来证明商家的非法改装行为以及你的损失情况。
- 报警处理：如果商家的改装行为涉嫌违法（如使用伪劣部件、违反安全标准等），你可以向公安机关报案，要求他们进行调查处理。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买商品时享有知情权、选择权、公平交易权等基本权利。商家非法改装电动车并拒不承认的行为，侵犯了你的合法权益。
- 在处理此类纠纷时，建议你保持冷静和理性，通过合法途径来维护自己的权益。避免采取过激行为或非法手段，以免给自己带来不必要的麻烦和损失。
- 如果你对法律程序不熟悉或担心自己的权益无法得到有效保障，可以寻求专业律师的帮助。作为专注于刑事辩护和合同纠纷领域的律师，我可以为你提供专业的法律咨询和代理服务。
可能法律后果：
- 如果商家被证实存在非法改装行为并拒不承认，他们可能面临市场监管部门的处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 如果商家的行为给你造成了经济损失或人身伤害，他们还需要承担相应的民事赔偿责任。在严重的情况下，如果商家的行为涉嫌犯罪（如生产、销售伪劣产品罪等），他们还可能面临刑事责任的追究。
总结与进一步行动建议：
面对非法改装电动车商家拒不承认的情况，你应首先收集证据，然后与商家协商，协商无果则向相关部门投诉或考虑法律途径。在整个过程中，保持冷静和理性至关重要。如果你需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问。