税务专管员收取1000元是否违法，需结合具体情形判断，可能存在违法与合法两种情况：

1. 若该1000元属于索贿、受贿或违规收取费用
   根据《中华人民共和国刑法》第三百八十五条，国家工作人员利用职务上的便利，索取他人财物或非法收受他人财物，为他人谋取利益的，构成受贿罪。税务专管员作为国家税务机关工作人员，若以职权为条件，主动索要或收受纳税人1000元财物（如现金、礼品等），且未提供合法对价服务，则属于违法行为。即使未达到刑事立案标准（如数额较小），也可能违反《中华人民共和国公务员法》第五十九条，面临行政处分（如警告、记过、降级等）。

2. 若该1000元属于合法代收费用或合理补偿
   若税务专管员收取的1000元有明确法律依据（如代收滞纳金、罚款，或因纳税人原因产生的合理费用补偿），且符合税务机关规定的收费标准与程序（如开具正式票据、经纳税人签字确认），则属于合法行为。例如，纳税人逾期申报需缴纳滞纳金，税务专管员按流程代收并上缴国库，此时收取行为合法。

建议行动：

• 若您怀疑税务专管员存在违规收费，可要求其出示收费依据（如文件、票据），并核实是否符合税务机关公示的收费标准。
  
• 若确认属于索贿或违规收费，可向当地税务局纪检部门举报，或通过“12366”税务服务热线投诉，必要时可向公安机关报案。
  
• 若涉及合法费用，建议保留相关票据，避免后续争议。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景细节。