单位自行网上采购是否合法，需根据具体情况判断，一般来说，在符合相关法律法规和单位内部规定的前提下，单位自行网上采购是合法的。以下从不同角度进行分析：
一、法律法规层面
采购主体与资格：
- 单位作为采购主体，需具备相应的民事行为能力和采购资格。只要单位是依法设立并具备独立承担民事责任能力的法人或其他组织，就具备进行采购活动的主体资格。
- 网上采购作为一种采购方式，并不改变采购主体的法律地位和资格要求。因此，单位只要具备采购资格，就可以通过网上平台进行采购。
采购程序与合规性：
- 网上采购需遵循相关的法律法规和采购程序。例如，对于政府采购项目，需遵循《中华人民共和国政府采购法》及其相关规定，确保采购活动的公开、公平、公正和诚实信用。
- 对于非政府采购项目，单位也应制定内部采购管理制度，明确采购流程、审批权限和监督机制等，以确保采购活动的合规性和有效性。
- 若单位自行网上采购时违反了相关法律法规或内部规定，如未进行公开招标、未履行审批程序等，则可能面临法律风险和内部纪律处分。
采购合同与履行：
- 网上采购通常涉及电子合同的签订和履行。根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，电子合同与书面合同具有同等法律效力。
- 单位在签订电子合同时，应确保合同内容明确、合法，并妥善保存合同文本和相关证据。在合同履行过程中，单位应按照合同约定履行义务，确保采购活动的顺利进行。
二、单位内部规定层面
采购权限与审批：
- 单位内部可能对采购活动设有不同的权限和审批程序。例如，某些大额采购项目可能需要经过单位领导班子集体决策或上级主管部门审批。
- 单位在自行网上采购时，应确保采购活动符合内部权限和审批程序的要求，避免未经授权或越权采购的情况发生。
采购监督与审计：
- 单位内部可能设有采购监督和审计机制，以确保采购活动的合规性和透明度。例如，通过内部审计或外部审计对采购活动进行监督和检查。
- 单位在自行网上采购时，应积极配合内部监督和审计工作，提供必要的资料和证据，确保采购活动的合法性和合规性。
三、实际操作建议
完善内部采购管理制度：
- 单位应制定完善的内部采购管理制度，明确采购流程、审批权限、监督机制等，以确保采购活动的合规性和有效性。
加强采购人员培训：
- 单位应加强对采购人员的培训和教育，提高其法律意识和采购技能，确保采购活动的顺利进行。
谨慎选择网上采购平台：
- 单位在选择网上采购平台时，应谨慎选择信誉良好、服务优质的平台，并签订详细的电子合同，明确双方的权利和义务。
保留相关证据和资料：
- 单位在自行网上采购过程中，应妥善保存合同文本、交易记录、支付凭证等相关证据和资料，以备不时之需。
若单位在自行网上采购过程中遇到任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。