被破产申请公司的法定代表人不配合，可能会承担民事责任、行政责任甚至刑事责任，具体取决于其不配合的行为性质和后果。以下从不同角度详细分析：
一、民事责任
损害赔偿责任：
- 如果法定代表人的不配合行为导致公司财产损失或债权人利益受损，例如故意隐匿、转移财产，或者拒绝提供必要的财务资料等，根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，法定代表人可能需要承担损害赔偿责任。这种责任是基于其作为公司管理者的忠实和勤勉义务，若违反这些义务并造成损失，就应承担相应的民事赔偿责任。
妨碍清算责任：
- 在破产清算过程中，如果法定代表人故意不配合清算工作，如拒绝移交账簿、重要文件等，导致清算工作无法顺利进行，根据《中华人民共和国企业破产法》的规定，法定代表人可能会被认定为妨碍清算，并因此承担相应的民事责任。这种责任可能包括赔偿因妨碍清算而给债权人造成的损失。
二、行政责任
- 罚款与限制措施：
- 如果法定代表人的不配合行为违反了相关行政法规或规章，例如拒绝履行法院或破产管理人的合法要求，行政机关可能会对其处以罚款、限制高消费、限制出境等行政处罚措施。这些措施旨在强制法定代表人履行其义务，并维护破产程序的顺利进行。
三、刑事责任
隐匿、故意销毁会计凭证、会计账簿、财务会计报告罪：
- 如果法定代表人在破产过程中故意隐匿、销毁会计凭证、会计账簿或财务会计报告，情节严重的，根据《中华人民共和国刑法》第一百六十二条之一的规定，可能会构成此罪，并面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处二万元以上二十万元以下罚金的刑事处罚。
妨害清算罪：
- 如果法定代表人在公司、企业进行清算时，隐匿财产、对资产负债表或者财产清单作虚伪记载或者在未清偿债务前分配公司、企业财产，严重损害债权人或者其他人利益的，根据《中华人民共和国刑法》第一百六十二条的规定，可能会构成妨害清算罪，并面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处二万元以上二十万元以下罚金的刑事处罚。
其他相关犯罪：
- 如果法定代表人的不配合行为还涉及其他犯罪行为，如贪污、挪用资金等，那么还可能根据具体情节被追究相应的刑事责任。
建议：作为被破产申请公司的法定代表人，应当积极配合破产程序，履行相关义务，如提供必要的财务资料、协助清算工作等。如果确实存在困难或疑问，应及时与破产管理人或法院沟通，寻求合法合规的解决方案。若因不配合而面临法律责任，不仅会影响个人声誉和信用记录，还可能给个人带来严重的经济和精神负担。
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