企业自己设立招标代理公司负责自身项目的招投标，在符合一定条件下是合法的。以下从不同角度为您详细分析：

合法性基础

1. 法律未禁止：从现行法律法规的角度来看，并没有明确禁止企业设立自己的招标代理公司来负责自身项目的招投标工作。这意味着，在法律层面，企业拥有这样的自主权。

2. 公平竞争与透明度：虽然法律未禁止，但企业设立自己的招标代理公司时，必须确保招投标过程的公平、公正和透明。这包括确保所有潜在投标人都能获得平等的竞争机会，以及招投标信息的公开透明。如果企业利用自己的招标代理公司进行不正当操作，如内定中标人、泄露招投标信息等，则可能构成违法行为。

潜在风险与合规建议

1. 利益冲突：企业设立自己的招标代理公司可能引发利益冲突问题。例如，招标代理公司可能更倾向于选择与企业有长期合作关系或利益关联的投标人，从而损害其他潜在投标人的利益。为了避免这种情况，企业应建立严格的内部管理制度，确保招标代理公司的独立性和公正性。

2. 合规操作：企业在设立和使用自己的招标代理公司时，必须严格遵守相关法律法规和规章制度。这包括但不限于《招标投标法》、《招标投标法实施条例》等。企业应确保招投标过程的合法性、合规性，避免出现违法行为。

3. 监督与审计：为了确保招投标过程的公正性和透明度，企业应建立有效的监督和审计机制。这可以包括对招标代理公司的定期审计、对招投标过程的全程监督等。通过这些措施，企业可以及时发现并纠正可能存在的问题，确保招投标活动的顺利进行。

实际操作中的注意事项

1. 明确职责划分：企业应明确招标代理公司的职责和权限，避免其超越职责范围进行操作。同时，企业也应明确自身在招投标过程中的角色和责任，确保整个过程的顺利进行。

2. 加强培训与教育：企业应加强对招标代理公司员工的培训和教育，提高其专业素养和法律意识。这有助于确保招投标过程的合规性和公正性，减少潜在的法律风险。

3. 建立反馈机制：企业应建立有效的反馈机制，及时收集和处理潜在投标人和其他相关方的意见和建议。这有助于企业不断改进招投标工作，提高其公正性和透明度。

总结来说，企业自己设立招标代理公司负责自身项目的招投标在法律上是可行的，但必须确保招投标过程的公平、公正和透明，并严格遵守相关法律法规和规章制度。如果您在招投标过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。