被告在刑事案件中完全可以申请代理辩护，这是法律赋予其的重要权利。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国刑事诉讼法》第三十四条：明确规定，犯罪嫌疑人、被告人在侦查、审查起诉、审判阶段都有权委托辩护人。这一条款直接赋予了被告在刑事诉讼各阶段委托辩护人的权利。
2. 《中华人民共和国律师法》第二十八条：也规定，律师可以接受刑事案件犯罪嫌疑人、被告人的委托或者依法接受法律援助机构的指派，担任辩护人。这进一步确认了律师作为辩护人的合法地位。

二、申请代理辩护的意义

1. 提供专业法律帮助：刑事案件涉及复杂的法律程序和实体法律问题，被告往往缺乏相应的法律知识和经验。律师作为专业的法律人士，能够为被告提供全面的法律帮助，包括解释法律规定、分析案情、提出辩护意见等。
2. 增强辩护能力：在刑事诉讼中，被告面临国家公权力的追诉，可能遭受严厉刑罚。律师的介入能够增强被告的辩护能力，通过证据调查、质证等方式，为被告争取更有利的诉讼结果。
3. 确保司法公正：律师的参与有助于平衡控辩双方的力量，防止国家公权力的滥用，从而确保司法的公正与公平。

三、申请代理辩护的流程与注意事项

1. 选择合适的辩护人：被告可以根据自身情况和案件需求，选择合适的辩护人。通常，选择具有丰富刑事辩护经验的律师更为有利。
2. 及时委托：被告应在侦查、审查起诉或审判阶段及时委托辩护人，以便辩护人能够尽早介入案件，为被告提供法律帮助。
3. 配合辩护人工作：被告应积极配合辩护人的工作，提供必要的案件信息和证据材料，以便辩护人能够更好地为其辩护。

四、特殊情况下的法律援助

对于经济困难或特定案件的被告，法律援助机构应指派律师提供辩护。这是国家为保障被告合法权益而设立的一项重要制度。被告可以向当地法律援助机构申请法律援助，以获得免费的法律帮助。

总结来说，被告在刑事案件中申请代理辩护是完全合法且必要的。这不仅有助于被告更好地维护自身合法权益，也有助于确保司法的公正与公平。如果您或您身边的人面临刑事案件，并需要申请代理辩护，请随时向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。