结论：行驶证登记为货运但保险按非货运购买，出险后保险公司是否赔偿需分情况讨论，关键在于保险合同条款约定、事故性质及投保人是否履行如实告知义务。以下是具体分析：

1. 若保险合同明确约定“车辆用途需与行驶证一致”，且事故与货运行为直接相关

保险公司可能拒赔。根据《保险法》第五十二条，投保人需如实告知车辆实际用途。若行驶证登记为货运，但投保时选择“非营运”或“家庭自用”，且事故发生在运输货物过程中（如超载、货物固定不当导致侧翻等），保险公司可主张“投保人未如实告知”或“风险显著增加未通知”，从而拒绝赔偿。
典型场景：货车行驶证登记为“货运”，但投保时选择“非营运”，实际长期从事货物运输，因超载发生事故，保险公司可能以“改变使用性质导致风险增加”为由拒赔。

2. 若保险合同未明确限制车辆用途，或事故与货运行为无直接关联

保险公司可能需赔偿。若保险条款未明确要求车辆用途与行驶证一致，或事故原因与货运行为无关（如普通碰撞、自然灾害等），保险公司通常需按合同约定理赔。但需注意：

• 如实告知义务：投保时若保险公司询问车辆用途，投保人需如实回答。若故意隐瞒货运用途，可能影响理赔；
  
• 风险匹配性：若非货运保险的费率显著低于货运保险（如家庭自用车险费率低于营运货车险），保险公司可能主张“费率与风险不匹配”，但需举证证明该差异直接影响理赔决定。
  典型场景：货车行驶证登记为“货运”，但投保时选择“非营运”，事故因暴雨导致发动机进水（非货运行为导致），保险公司可能需赔偿。

3. 若保险公司未尽到提示说明义务

保险公司可能需赔偿。根据《保险法》第十七条，保险公司需对免责条款（如“车辆用途与行驶证不符不赔”）进行明确提示和说明。若未履行该义务，免责条款可能无效，保险公司仍需赔偿。
典型场景：投保时保险公司未询问车辆用途，或未在合同中明确标注“用途不符不赔”的条款，事故后保险公司以“用途不符”拒赔，法院可能不支持其主张。

建议

1. 核对保险合同条款：重点查看“保险责任”“责任免除”“车辆用途”等条款，确认是否对货运行为有明确限制；
   
2. 保留证据：如投保时保险公司未询问用途、未提示免责条款，或事故与货运行为无关，需留存相关证据（如投保单、沟通记录、事故现场照片等）；
   
3. 协商或诉讼：若保险公司拒赔，可先协商；协商不成，可向法院起诉，由法院根据合同约定和法律规定判决。
   

如有具体案件细节（如保险条款、事故原因等），可进一步向我咨询，我会结合实际情况分析理赔可能性。