判决书由单位收发室签收，在特定情况下是有效的。具体分析如下：

1. 法律依据：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第一百三十三条：“调解书应当直接送达当事人本人，不适用留置送达。当事人本人因故不能签收的，可由其指定的代收人签收。”虽然此条规定针对的是调解书，但同理可推，对于判决书，如果当事人本人因故不能签收，且其所在单位收发室是其惯常的收件地址，或者当事人已明确授权单位收发室代收法律文书，那么由单位收发室签收也是合理的。

2. 实际情况考量：在实际操作中，如果当事人所在单位收发室签收了判决书，并且该收发室有将文书转交给当事人的职责和习惯，或者当事人实际上已经知晓并认可了收发室的签收行为，那么可以认为判决书已经有效送达。

3. 特殊情形：但如果当事人并未授权单位收发室代收法律文书，或者收发室并未将文书转交给当事人，导致当事人未能及时知晓判决内容，那么这种签收行为可能不被视为有效送达。在这种情况下，当事人可以及时向法院提出异议，并要求重新送达。

综上所述，判决书由单位收发室签收是否有效，需要根据具体情况来判断。如果收发室签收符合当事人的惯常收件方式或已得到当事人的授权，且实际上已经转交给当事人或当事人已知晓并认可，那么可以认为送达有效。反之，则可能被视为无效送达。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。