合同协议书中可以写有权代表签字，这是完全合法且常见的做法。以下从多个角度为你详细分析：

法律角度

在合同签订过程中，有权代表签字是代表公司或组织行使权利、履行义务的一种常见方式。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。在合同书中，明确有权代表签字，是确认合同双方主体资格和意思表示真实性的重要环节。只要该代表具有合法的授权，其签字即视为公司或组织的真实意思表示，对合同双方均具有法律约束力。

实际操作角度

1. 明确授权范围：在合同协议书中写有权代表签字时，应明确该代表的授权范围，包括但不限于签署合同的权限、修改合同的权限等。这有助于避免后续因授权不明而产生的纠纷。
2. 签字流程规范：为了确保合同的有效性，有权代表在签字前应仔细阅读合同条款，确保理解并同意合同内容。同时，签字过程应遵循一定的规范，如使用正式的签字笔、在指定的签字位置签字等。
3. 留存证据：在合同签订后，应妥善留存合同原件及相关证据，如授权委托书、签字过程照片或视频等。这些证据在后续可能发生的纠纷中具有重要的证明作用。

风险防范角度

1. 核实代表身份：在合同签订前，应核实有权代表的身份和授权情况，确保其具有合法的代表资格和授权范围。这可以通过查看授权委托书、公司章程、股东会决议等文件来实现。
2. 明确违约责任：在合同协议书中，应明确约定违约责任和争议解决方式。这有助于在合同履行过程中，一旦发生纠纷，能够迅速、有效地解决争议，保护合同双方的合法权益。
3. 定期审查更新：随着公司或组织的发展和外部环境的变化，有权代表的授权范围和职责可能也会发生变化。因此，应定期审查并更新合同协议书中的相关内容，确保其与实际情况相符。

总结与建议：合同协议书中写有权代表签字是合法且常见的做法。为了确保合同的有效性和避免后续纠纷，建议在合同中明确授权范围、规范签字流程、留存相关证据，并核实代表身份、明确违约责任和定期审查更新合同内容。如果你在合同签订过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。