关于农村自打井是否违法的问题，这主要取决于是否获得了相关部门的批准和许可。

首先，我们需要明确的是，水资源，包括江河湖泊和地下水，都是国家所有的重要自然资源。为了保护和合理利用这些资源，国家实行了取水许可制度和水资源有偿使用制度。这意味着，任何单位或个人，如果想要直接从江河、湖泊或地下取用水资源，都需要按照国家的规定，向水行政主管部门或流域管理机构申请领取取水许可证，并缴纳相应的水资源费。

然而，也存在一些例外情况。比如，家庭生活和零星散养、圈养畜禽饮用等少量取水的，通常不需要申请取水许可证。但这种情况下的取水量是有限制的，且必须确保不会对水资源造成浪费或污染。

现在，我们回到农村自打井的问题上。如果未经相关部门批准，私自打井取水，特别是用于生产经营等非家庭生活用途的，那么这种行为就是违法的。因为这不仅违反了国家的取水许可制度，还可能对水资源造成污染或过度开采，进而影响到其他用户的用水权益和生态环境的平衡。

以实际案例来说，有村民未经许可擅自在家中打井取水，供给某建材公司用于生产经营，结果被相关部门依法进行了处罚。这个案例就很好地说明了，未经批准擅自打井取水是违法的，并且会受到法律的制裁。

因此，我建议，如果农村地区有打井取水的需求，一定要先向当地的水行政主管部门或流域管理机构咨询相关政策和手续，确保自己的行为符合法律法规的要求。这样不仅可以避免不必要的法律风险，还能为保护和合理利用水资源做出自己的贡献。