关于废机油企业能否收取冷却液发票以及是否合法的问题，这主要涉及到资源回收企业的“反向开票”政策。以下是对此问题的详细解答：
首先，我们需要明确“反向开票”的定义和适用范围。根据国家税务总局的公告，自2024年4月29日起，自然人报废产品出售者向符合条件的资源回收企业销售报废产品时，资源回收企业可以向出售者开具发票，这被称为“反向开票”。这里的报废产品，指的是在社会生产和生活消费过程中产生的，已经失去原有全部或部分使用价值的产品。
接下来，我们来看废机油企业是否属于可以“反向开票”的资源回收企业范畴。根据公告，实行“反向开票”的资源回收企业需要符合以下条件之一，并实际从事资源回收业务：
从事危险废物收集的，应当符合国家危险废物经营许可证管理办法的要求，取得危险废物经营许可证。废机油通常被视为危险废物，因此如果废机油企业取得了危险废物经营许可证，并实际从事废机油的回收业务，那么它属于可以“反向开票”的资源回收企业。
从事报废机动车回收的，需要符合国家商务主管部门出台的报废机动车回收管理办法要求，并取得报废机动车回收拆解企业资质认定证书。这一条件与废机油企业不直接相关，除非废机油企业同时从事报废机动车的回收业务。
除危险废物、报废机动车外，其他资源回收企业应当符合国家商务主管部门出台的再生资源回收管理办法要求，进行经营主体登记，并在商务部门完成再生资源回收经营者备案。如果废机油企业回收的不仅仅是废机油，还包括其他再生资源，并且符合这一条件，那么它也可以被视为可以“反向开票”的资源回收企业。
现在，我们回到原问题：废机油企业能否收取冷却液发票？这取决于冷却液是否被视为报废产品，并且废机油企业是否符合“反向开票”的条件。如果冷却液被视为报废产品，并且废机油企业已经取得了危险废物经营许可证（或符合其他相关条件），并且实际从事了冷却液的回收业务，那么它理论上是可以向出售冷却液的自然人“反向开票”的。然而，这并不意味着废机油企业可以随意收取任何与冷却液相关的发票，而是需要确保发票的开具符合税务法规和“反向开票”的政策要求。
至于合法性，只要废机油企业符合“反向开票”的条件，并且按照税务法规和政策要求正确开具和收取发票，那么这种行为是合法的。但是，如果废机油企业不符合相关条件，或者存在虚开发票、骗取税款等违法行为，那么它将面临税务机关的处罚和法律责任。
综上所述，废机油企业能否收取冷却液发票并合法，取决于其是否符合“反向开票”的条件，并且是否按照税务法规和政策要求正确开具和收取发票。因此，建议废机油企业在开展相关业务时，务必咨询当地税务机关或专业税务顾问的意见，以确保合规经营。