在基本农田上建房，未经合法批准通常会被认定为违法建筑，违反了《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据与违法性认定

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》的规定，国家实行严格的土地用途管制制度，严格限制农用地转为建设用地，并对耕地实行特殊保护。基本农田作为耕地中的精华部分，其保护力度更为严格。未经依法批准，不得在基本农田上进行非农业建设，包括建房。因此，在基本农田上建房，若未经合法审批手续，将违反土地管理法律法规，被认定为违法建筑。

2. 违法建筑的后果处理

   • 一旦被发现存在违法建筑，相关部门有权责令停止建设、限期改正。若逾期不改正，将面临拆除等处罚措施。这些措施旨在维护土地管理的秩序，保护耕地资源，防止非法占用和破坏。

3. 特殊情况下的合法性探讨

   • 虽然一般情况下在基本农田上建房是违法的，但也存在特殊情况。例如，因国家能源、交通、水利、军事设施等重点建设项目选址确实无法避开永久基本农田的，涉及农用地转用或土地征收的，必须经国务院批准。经过合法的审批流程，改变土地性质和用途后，在该土地上进行建设则不属于违法建筑。但这种情况主要针对重大建设项目，并非普通村民个人建房情形。
   • 对于农村村民而言，若需建房，应符合乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。若符合分户条件等规定，应通过合法途径申请宅基地来建房，以确保建房的合法性。

4. 建房需符合规划与审批要求

   • 建房不仅需要符合土地管理法律法规，还需要符合当地的城乡规划和土地利用总体规划。不能随意找块地就建房，否则可能因违反规划而面临处罚。
   • 建房前必须办理相关的审批手续，包括建设用地批准书、建设工程规划许可证等。只有这些手续齐全了，才能确保建房的合法合规性。

总结与建议： 在基本农田上建房需严格遵守国家法律法规和政策要求。未经合法批准擅自建房将被认定为违法建筑，并面临相应的处罚措施。因此，建议村民在建房前务必咨询当地相关部门，了解清楚法律法规和政策要求，并按照规定的程序办理审批手续，确保建房的合法合规性。若您在房产纠纷领域有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。