公司让员工签保密协议是合法的，但前提是协议内容必须合法、合理，且充分尊重和保护员工的合法权益。以下是对这一问题的详细分析：

法律依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第二十二条：明确劳动合同当事人可以在劳动合同中约定保守用人单位商业秘密的有关事项。这为公司与员工签订保密协议提供了基本的法律框架。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条：详细规定用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。这一条款进一步明确了保密协议的合法性和具体内容要求。

保密协议的合法性与合理性

1. 明确保密范围：保密协议应清晰界定哪些信息属于保密范畴，如客户名单、产品研发资料、未公开的财务数据等。避免使用模糊宽泛的表述，以确保员工能够明确了解哪些信息需要保密。

2. 合理的保密期限：保密期限应根据商业秘密的性质和行业惯例设定，不能过长到不合理的程度。通常，保密期限可以是几年到十几年不等，具体取决于商业秘密的存续期限和保护需求。

3. 支付保密补偿（针对竞业限制条款）：若保密协议中包含竞业限制条款，公司应在竞业限制期限内按月给予员工经济补偿。这是为了平衡员工在离职后因遵守竞业限制而可能遭受的损失。未约定补偿的，竞业限制条款可能不被法律支持。

4. 不违反法律法规：保密协议的内容必须遵守国家法律法规的强制性规定，不得侵犯员工的合法权益，如隐私权、劳动权等。例如，协议中不得包含限制员工基本就业自由的条款。

员工的权利与义务

1. 权利：员工在签订保密协议前，有权了解并审阅协议的全部内容，确保条款的合法性和合理性。如发现协议存在违法或不合理的部分，员工有权拒绝签订，并可寻求法律援助或咨询。

2. 义务：一旦签订保密协议，员工需严格遵守保密义务，防止商业秘密泄露。违反协议可能面临民事责任甚至刑事责任的追究。

公司的责任

公司应明确告知员工保密信息的范围、保密期限以及违约责任等内容，确保员工充分了解并同意。若要求员工离职后继续履行保密义务，公司需在保密协议中明确竞业限制条款，并按约定支付经济补偿。

实际应用中的注意事项

• 协议内容的具体性：保密协议应尽可能具体明确，避免使用模糊或宽泛的表述。这有助于减少争议和误解。
• 双方自愿原则：签订保密协议应基于双方自愿原则，不得存在欺诈、胁迫等情形。否则，协议可能被视为无效。
• 定期审查与更新：随着公司业务的发展和法律法规的变化，保密协议可能需要定期审查和更新。以确保其始终符合法律法规的要求和公司的实际需求。

综上所述，公司让员工签保密协议是合法的，但前提是协议内容必须合法、合理，且充分尊重和保护员工的合法权益。员工在签订前应仔细审查协议条款，确保自身权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。