针对您提出的“离婚诉讼二审判决书下来后，孩子抚养权归女方，但户口在父亲那里，如何变更”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、抚养权变更与户口迁移的关系
首先，需要明确的是，抚养权的变更与户口的迁移是两个相对独立但又相互关联的法律程序。抚养权的变更已经通过法院的二审判决书确定，即孩子现在由女方抚养。而户口的迁移，则是为了保障孩子的生活、教育等权益，需要将其户口从原父亲处迁移至母亲处。
二、户口迁移的法律依据
根据《中华人民共和国户口登记条例》以及相关法律法规，父母离婚后，未成年子女的户口原则上应随抚养方迁移。这是为了保障未成年子女的合法权益，便于其享受抚养方所在地的教育、医疗等公共服务。
三、户口迁移的具体流程
准备材料：
- 法院的二审判决书（证明抚养权已变更至女方）；
- 孩子的出生医学证明；
- 女方的身份证、户口簿；
- 男方（原抚养方）的身份证、户口簿（用于办理迁出手续）；
- 若双方协商一致，可签订一份户口迁移协议书，明确双方的权利和义务。
办理迁出手续：
- 女方需携带上述材料，与男方一同前往男方户口所在地的派出所，办理孩子的户口迁出手续。若男方无法亲自前往，可委托女方代为办理，但需提供男方签署的委托书及男方的身份证复印件。
办理迁入手续：
- 女方在办理完迁出手续后，需携带孩子的户口迁移证、女方的身份证、户口簿等材料，前往女方户口所在地的派出所，办理孩子的户口迁入手续。
四、注意事项
协商一致：
- 在办理户口迁移过程中，若双方能够协商一致，将大大简化流程并减少不必要的纠纷。因此，建议双方在办理前进行充分沟通，达成一致意见。
法律途径：
- 若男方拒绝配合办理户口迁移手续，女方可以依据法院的判决书，向当地公安机关申请强制执行，或者通过法律途径提起诉讼，要求男方履行协助义务。
保障孩子权益：
- 在整个户口迁移过程中，应始终以孩子的最大利益为出发点，确保孩子的合法权益不受侵害。
五、相关法律规定
- 《中华人民共和国户口登记条例》第十条：公民迁出本户口管辖区，由本人或者户主在迁出前向户口登记机关申报迁出登记，领取迁移证件，注销户口。
- 《中华人民共和国未成年人保护法》第二十四条：未成年人的父母离婚时，应当妥善处理未成年子女的抚养、教育、探望、财产等事宜，听取有表达意愿能力未成年人的意见。
综上所述，您可以在准备好相关材料后，与男方协商一致或通过法律途径，按照上述流程办理孩子的户口迁移手续。希望这些信息能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。