挪用公司房租四十万属于严重的违法行为，可能涉及刑事犯罪，需立即采取补救措施并配合调查，具体处理方式如下：

1. 立即归还挪用款项
   无论挪用资金是否已用于个人用途，首要任务是全额归还四十万房租至公司账户。若资金已被消耗，需通过变卖资产、借款等方式筹集资金归还，以最大限度减轻法律后果。根据《刑法》第二百七十二条，挪用资金罪的立案标准为“数额较大”（通常为10万元以上），四十万已远超该标准，归还行为虽不能完全免责，但可作为从轻情节。

2. 主动向公司坦白并配合调查
   需向公司管理层如实说明挪用原因、资金去向及归还计划，并配合公司内部审计或调查。若公司选择报警，主动配合可体现悔罪态度，影响司法机关对“主观恶性”的认定。若公司未报警，仍需保留书面坦白记录（如邮件、书面说明），避免后续被指控“隐瞒犯罪”。

3. 评估是否构成刑事犯罪

   • 若挪用资金用于个人营利活动（如投资、经商）：根据《刑法》第二百七十二条，可能构成“挪用资金罪”，处三年以下有期徒刑或拘役；数额巨大（通常为400万元以上）或拒不归还的，处三年以上十年以下有期徒刑。四十万虽未达“数额巨大”标准，但若超过三个月未归还，仍可能被追责。
     
   • 若挪用资金用于非法活动（如赌博、吸毒）：无论金额大小，均构成挪用资金罪，且无“数额较大”限制，直接面临三年以下有期徒刑或拘役。
     
   • 若挪用后短期内归还且未造成损失：可能被认定为“情节轻微”，司法机关可能酌情不起诉或免予刑事处罚，但需以归还行为为前提。

4. 准备应对刑事诉讼
   若公司或公安机关立案，需立即委托律师介入。律师可协助：

   • 与公司协商和解（如签订还款协议、赔偿损失）；
     
   • 向公安机关提交《不予立案申请书》（若证据不足或情节轻微）；
     
   • 在侦查阶段申请取保候审；
     
   • 在审判阶段争取缓刑或减轻处罚（如自首、立功、认罪认罚等）。

5. 民事赔偿与信用修复
   即使未被追究刑事责任，仍需承担民事赔偿责任，包括归还本金、支付利息（如公司主张）及赔偿因挪用导致的损失（如公司因资金短缺产生的违约金）。此外，挪用行为可能被记录在个人征信系统，影响未来贷款、就业等，需通过书面道歉、公开说明等方式修复与公司关系。

特别提醒：挪用资金罪的追诉时效为十年，即使暂时未被发现，后续仍可能被追责。建议尽快处理，避免问题恶化。如有进一步疑问或需具体方案，可直接向我咨询。