扰乱公共秩序罪在被人民法院审判认定有罪并判处刑罚（包括管制、拘役、有期徒刑等主刑）后，会留下案底；但如果仅被判处罚金、剥夺政治权利等附加刑，或者因证据不足等原因未被定罪，则不会留下案底。对于未成年人犯罪记录，还有特别的封存规定。以下是对此问题的详细分析：
一、扰乱公共秩序罪的定义与案底的关系
扰乱公共秩序罪是《中华人民共和国刑法》分则第六章第一节规定的一类罪名的统称，它包含如聚众扰乱社会秩序、聚众冲击国家机关等多种具体罪名。这类犯罪通常涉及对公共秩序的破坏，情节严重时可能构成刑事犯罪。而案底，一般指某人过去犯罪行为的记录，即犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中，这通常指有过刑事犯罪前科的档案记录，该犯罪档案一般存放于公安部门与相关国家机关。
二、刑罚种类与案底的形成
主刑与案底：如果行为人因触犯扰乱公共秩序罪中的具体罪名，被人民法院审判认定有罪并判处主刑（如管制、拘役、有期徒刑等），则会留下案底。这是因为主刑的判处意味着行为人已经构成了犯罪，并需要承担相应的刑事责任。
附加刑与案底：如果行为人仅被判处罚金、剥夺政治权利等附加刑，而没有同时被判处主刑，那么根据法律规定，这种情况下是不会留下案底的。附加刑虽然也是刑罚的一种，但它并不直接表明行为人构成了犯罪，而是作为对犯罪行为的额外惩罚。
三、特殊情况下的案底问题
未被定罪的情况：如果行为人只是涉嫌扰乱公共秩序罪被公安机关立案侦查，但最终因证据不足等原因被撤销案件，或者人民检察院决定不起诉，又或者人民法院判决无罪，那么在这种情况下，行为人是不会留下案底的。因为案底的形成需要以法院的有罪判决为前提。
未成年人犯罪记录的封存：对于犯罪时不满十八周岁、被判处五年有期徒刑以下刑罚的未成年人，根据相关法律规定，其犯罪记录会被予以封存。这在一定程度上也相当于没有留下案底，体现了法律对未成年人的特殊保护。
四、案底的影响与建议
案底不仅会影响到犯罪者的个人生活，如在就业、升学等方面可能会受到限制，还会对其社会声誉等方面产生负面影响。因此，我建议公众在日常生活中要遵守法律法规，维护公共秩序，避免参与任何违法犯罪活动。如果不幸涉及相关法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。
综上所述，扰乱公共秩序罪是否会留案底，取决于行为人是否被人民法院审判认定有罪并判处主刑，以及是否存在特殊情况。在处理此类问题时，应综合考虑多个因素，并寻求专业法律帮助以确保自身权益得到妥善保护。