农民将水池子填平后作为耕地使用，这一行为是否合法，需分情况讨论：
若水池子原本属于耕地范畴，且填平行为未改变土地用途性质
- 在这种情况下，如果水池子原本就是耕地的一部分，或者该地块在土地利用规划中仍被划分为耕地，农民将其填平后继续作为耕地使用，通常是被允许的。但需要注意的是，填平行为本身应当符合相关的土地管理规定，比如不得破坏土地的耕作层，不得造成水土流失等环境问题。如果填平过程中涉及到了挖掘、搬运等作业，还需要确保这些作业活动不会对周边环境或他人权益造成损害。
若水池子原本不属于耕地范畴，或填平行为改变了土地用途性质
- 如果水池子原本属于建设用地、林地、草地等其他类型的土地，或者虽然原本属于耕地但填平后计划用于非农业用途（如建设住宅、商业设施等），那么这一行为就可能涉及违法。根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，任何单位和个人不得侵占、买卖或者以其他形式非法转让土地，也不得擅自改变土地用途。如果农民未经批准擅自将非耕地填平作为耕地使用，或者虽然原本属于耕地但填平后改变了其农业用途，都可能面临土地管理部门的处罚，包括责令限期改正、没收违法所得、罚款等。
法律建议：
- 在进行任何土地填平或用途变更行为前，农民应当先了解清楚该地块的土地利用规划和用途管制要求，确保自己的行为符合法律法规的规定。
- 如果确实需要改变土地用途或进行填平作业，应当事先向当地土地管理部门申请批准，并按照批准的要求进行作业。
- 在作业过程中，应当注意保护环境，避免造成水土流失、污染等环境问题，确保自己的行为不会对周边环境或他人权益造成损害。
可能后果：
- 如果未经批准擅自改变土地用途或进行填平作业，农民可能面临土地管理部门的处罚，包括责令限期改正、没收违法所得、罚款等。
- 如果填平行为造成了环境损害或他人权益受损，农民还可能面临民事赔偿或刑事责任等法律后果。
因此，农民在将水池子填平后作为耕地使用前，务必确保自己的行为符合法律法规的规定，避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。