非普通住宅的核定主体主要是地方税务机关，其核定依据主要包括相关税收法律法规及地方性规定。以下从法律依据和实际操作两个角度进行详细分析：
法律依据
税收法律法规：
- 根据《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则，税务机关有权对纳税人的应纳税额进行核定。在房产交易领域，这通常涉及对房产性质的核定，包括是否为普通住宅或非普通住宅，因为这直接影响到房产交易的税收计算。
- 具体到房产税、契税等税种，相关法律法规可能并未直接规定非普通住宅的核定主体，但明确了税务机关在税收征管中的职责和权限，从而间接支持了税务机关在非普通住宅核定中的角色。
地方性规定：
- 各地为了规范房地产市场，往往会出台一系列地方性规定，对普通住宅和非普通住宅的标准进行明确界定。这些规定通常包括住宅的建筑面积、容积率、价格等因素，并据此划分普通住宅和非普通住宅。
- 在这些地方性规定中，往往会明确税务机关在房产交易税收征管中的具体职责，包括非普通住宅的核定工作。例如，某些地方可能规定，税务机关在受理房产交易纳税申报时，需根据地方性规定对房产性质进行核定，并据此计算应纳税额。
实际操作
核定流程：
- 在实际操作中，当纳税人进行房产交易并申报纳税时，税务机关会根据纳税人提供的房产信息（如购房合同、房产证等）以及地方性规定中的普通住宅和非普通住宅标准，对房产性质进行核定。
- 如果房产符合普通住宅的标准，则按照普通住宅的税收政策计算应纳税额；如果不符合，则按照非普通住宅的税收政策计算。
争议处理：
- 如果纳税人对税务机关的核定结果有异议，可以依法提出行政复议或行政诉讼。在复议或诉讼过程中，税务机关需要提供充分的证据证明其核定结果的合法性和合理性。
- 同时，纳税人也可以咨询专业律师或相关机构，了解自己的权益和义务，以及可能的法律救济途径。
总结来说，非普通住宅的核定主体主要是地方税务机关，其核定依据包括相关税收法律法规及地方性规定。在实际操作中，税务机关会根据纳税人提供的房产信息和地方性规定对房产性质进行核定，并据此计算应纳税额。如果您对非普通住宅的核定有进一步的问题或需要法律帮助，请直接向我咨询。