结论：宅基地邻里协议被法院认定有效的情况下，邻居占用您20公分宅基地的行为，并不直接导致您的房子成为违法建筑，但邻居的行为可能构成侵权，您有权要求其停止侵害、恢复原状或赔偿损失。

分析说明：

1. 邻里协议的法律效力：

   • 邻里协议，若经双方自愿、平等协商达成，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，则该协议具有法律效力。法院认定该协议有效，意味着双方应受其约束，按照协议内容履行各自义务。

2. 邻居占用宅基地的行为性质：

   • 邻居占用您20公分宅基地的行为，若未经您同意，且超出了邻里协议约定的范围，则构成对您宅基地使用权的侵害。这种侵害行为，并不直接导致您的房子成为违法建筑，因为房子的合法性主要取决于其建设是否符合规划、审批等法定程序。

3. 您房子的合法性：

   • 您的房子是否违法，主要取决于其建设是否取得了相应的规划许可、施工许可等法定证件，以及是否按照许可的内容进行建设。如果您的房子建设合法，那么邻居的占用行为就不会改变其合法性。但如果您的房子本身存在违法建设的情况，那么邻居的占用行为可能会加剧这一违法性，但两者并不直接等同。

4. 您的权利救济途径：

   • 鉴于邻居的占用行为可能构成侵权，您有权依据《民法典》等相关法律法规，要求邻居停止侵害、恢复原状或赔偿损失。如果邻居拒绝履行，您可以向法院提起诉讼，要求法院强制执行。

行动建议：

• 收集证据：首先，您需要收集能够证明邻居占用您宅基地的证据，如邻里协议、宅基地使用权证、现场照片、视频等。
• 协商沟通：在收集到足够证据后，您可以尝试与邻居进行协商沟通，要求其停止侵害并恢复原状。如果协商无果，您可以考虑采取法律手段。
• 提起诉讼：如果邻居拒绝履行义务，您可以向法院提起诉讼，要求法院判决邻居停止侵害、恢复原状或赔偿损失。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来支持自己的主张。

后续思考：

• 在处理此类纠纷时，除了关注房子的合法性外，还需要关注宅基地使用权的归属和邻里协议的履行情况。只有全面考虑这些因素，才能更好地维护自己的合法权益。
• 如果您对宅基地使用权、邻里协议或侵权责任等方面的法律问题存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。