结论：受贿五千元司法机关立案后，是否会通知被举报人，需分情况讨论，一般情况下立案后不一定会立即通知被举报人，但在后续侦查、审查起诉等阶段，被举报人会知晓相关情况。
分析说明：
立案阶段：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，司法机关在决定立案后，主要任务是开始侦查活动，收集证据，查明犯罪事实。在此阶段，司法机关通常不会立即通知被举报人（即犯罪嫌疑人）其已被立案侦查。这是因为通知可能会干扰侦查活动，导致证据灭失或犯罪嫌疑人逃匿。
- 然而，如果司法机关认为有必要对犯罪嫌疑人采取强制措施（如拘留、逮捕等），则会在采取措施前或同时通知犯罪嫌疑人及其家属。但这种情况并非立案后的必然程序，而是根据案件具体情况和侦查需要决定的。
侦查阶段：
- 在侦查阶段，司法机关会依法对犯罪嫌疑人进行讯问、询问证人、搜查、扣押等侦查活动。在此过程中，犯罪嫌疑人会逐渐知晓自己已被立案侦查，并可能面临刑事指控。
- 如果犯罪嫌疑人被采取强制措施，如拘留或逮捕，司法机关会在执行强制措施时通知犯罪嫌疑人及其家属，并告知其享有的权利和义务。
审查起诉阶段：
- 当侦查活动结束后，司法机关会将案件移送检察机关审查起诉。在此阶段，检察机关会依法对案件进行审查，并决定是否对犯罪嫌疑人提起公诉。
- 在审查起诉阶段，犯罪嫌疑人及其辩护律师有权查阅案卷材料，了解案件情况，并提出辩护意见。因此，犯罪嫌疑人在此阶段会明确知晓自己已被立案侦查，并面临刑事指控。
特殊情况与注意事项：
- 如果受贿行为情节轻微，司法机关可能决定不予立案或撤销案件。在此情况下，被举报人可能不会知晓自己曾被举报或立案侦查。
- 司法机关在办理案件过程中，会严格遵守法定程序和保密规定，确保案件处理的公正性和合法性。因此，即使被举报人未被立即通知，也不应担心自己的合法权益受到侵害。
行动建议：
- 如果您或您身边的人涉嫌受贿行为，并担心被司法机关立案侦查，建议保持冷静，不要试图逃避或干扰侦查活动。
- 如有需要，可以及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并寻求法律帮助。律师将根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和辩护策略。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。