若刑事案件申诉三个月到期无回复，可采取以下措施：
首先，建议主动联系受理申诉的法院或检察院，询问申诉的进展情况。由于司法机关可能因案件量大、流程复杂等原因导致处理时间延长，主动沟通可以及时获取案件的最新动态，了解是否存在需要补充材料或进一步说明的情况。
回顾提交的申诉材料，确认是否齐全、符合法定要求。如果材料存在缺失或不符合规定，可能导致申诉无法及时处理。此时，可以根据受理机关的要求，及时补充或修正材料，以加快申诉进程。
如果联系受理机关后仍未得到明确答复，或者认为受理机关的处理存在不当，可以考虑向上级法院或检察院申请监督。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，上级机关有权对下级机关的申诉处理进行监督，确保申诉得到公正、及时的处理。
在处理申诉过程中，如果感到困惑或无助，可以寻求法律援助或咨询专业律师。律师具备专业的法律知识和丰富的实践经验，能够为你提供有针对性的法律建议和帮助，确保你的申诉权益得到充分保障。
在采取上述措施的同时，也要关注申诉的期限和程序要求。确保在法定期限内提出申诉，并按照规定的程序进行操作。如果因自身原因错过申诉期限或违反程序要求，可能导致申诉被驳回或无法得到处理。