若使用工厂代投标且已中标，该行为涉嫌违法，中标结果可能被认定无效，相关责任人还可能面临行政处罚甚至刑事处罚，建议立即停止该行为并主动向相关部门说明情况。以下从不同角度详细分析：

法律后果层面

1. 中标无效：根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条规定，投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，投标人以向招标人或者评标委员会成员行贿的手段谋取中标的，中标无效。工厂代投标属于串通投标的一种形式，一旦被发现，中标结果会被依法认定为无效。这意味着之前为中标所做的一系列努力和投入都可能付诸东流，而且可能还需要承担因中标无效给招标人和其他投标人造成的损失赔偿责任。
2. 行政处罚：除了中标无效外，相关责任主体还会面临行政处罚。依据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员处单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款；有违法所得的，并处没收违法所得；情节严重的，取消其一年至二年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格并予以公告，直至由工商行政管理机关吊销营业执照。例如，如果工厂代投标行为情节较为严重，工厂可能会被取消一至两年内参与相关项目投标的资格，这对于工厂的业务开展会造成极大的阻碍。
3. 刑事处罚：在情节严重的情况下，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》第二百二十三条，投标人相互串通投标报价，损害招标人或者其他投标人利益，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。投标人与招标人串通投标，损害国家、集体、公民的合法利益的，依照前款的规定处罚。如果工厂代投标行为造成了严重的后果，如给国家、集体或者公民利益造成了重大损失，相关责任人可能会面临刑事处罚。

应对措施层面

1. 主动说明情况：在发现使用工厂代投标中标后，应立即停止该违法行为的进一步实施，并主动向招标人、招标代理机构以及相关行政监督部门说明情况。主动说明情况可以在一定程度上表明悔过态度，有可能减轻后续的法律责任。例如，向招标人如实陈述代投标的事实经过，表达愿意承担相应责任的意愿。
2. 配合调查处理：积极配合相关部门的调查工作，提供真实、准确的信息和证据。在调查过程中，要如实回答调查人员的问题，不得隐瞒、谎报或者提供虚假材料。配合调查有助于相关部门尽快查明事实真相，作出公正的处理决定。
3. 协商解决纠纷：如果因为代投标行为给招标人或者其他投标人造成了损失，应主动与对方进行协商，寻求合理的解决方案。可以通过赔偿损失、重新招标等方式来弥补对方的损失，尽量减少纠纷的扩大和恶化。例如，与招标人协商确定赔偿金额和赔偿方式，以达成和解协议。