在买卖合同纠纷中，若对方为自然人独资企业，一般情况下可以直接起诉该自然人独资企业的股东，但需满足一定条件，即该股东不能证明公司财产独立于股东自己的财产。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国公司法》第六十三条：“一人有限责任公司的股东不能证明公司财产独立于股东自己的财产的，应当对公司债务承担连带责任。”这一条款明确规定了一人有限责任公司（包括自然人独资企业）的股东在特定情况下需对公司债务承担连带责任。
二、情况分析
股东财产与公司财产独立：
- 如果自然人独资企业的股东能够证明公司财产独立于其个人财产，那么在买卖合同纠纷中，原告通常只能起诉该企业，而不能直接起诉股东。
- 股东可以通过提供公司财务报表、审计报告等证据来证明公司财产的独立性。
股东财产与公司财产不独立：
- 如果股东无法证明公司财产独立于其个人财产，或者存在财产混同的情况（如股东将公司资金用于个人消费、股东个人账户与公司账户混用等），那么根据《公司法》第六十三条的规定，股东应当对公司债务承担连带责任。
- 在这种情况下，原告可以同时起诉自然人独资企业和其股东，要求股东对公司债务承担连带责任。
三、实际操作建议
收集证据：
- 在起诉前，原告应尽可能收集能够证明股东财产与公司财产是否独立的证据，如公司财务报表、审计报告、银行流水等。
- 如果怀疑股东存在财产混同的情况，可以申请法院调取相关证据或委托专业机构进行审计。
起诉策略：
- 如果证据充分，能够证明股东财产与公司财产不独立，那么原告可以在起诉时同时列明自然人独资企业和其股东为被告，要求股东承担连带责任。
- 如果证据不足，或者无法确定股东财产是否独立，那么原告可以先起诉自然人独资企业，待在诉讼过程中或执行阶段发现股东存在财产混同等情况时，再追加股东为被告或申请执行股东的财产。
四、风险提示
- 起诉股东需要承担一定的举证责任，如果无法提供充分证据证明股东财产与公司财产不独立，那么可能面临败诉的风险。
- 即使起诉了股东并获得了胜诉判决，如果股东没有可供执行的财产，那么原告仍然可能面临执行难的问题。
综上所述，在买卖合同纠纷中，若对方为自然人独资企业，原告可以根据股东财产与公司财产是否独立的情况来决定是否同时起诉股东。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。