企业垃圾处理费的缴纳义务主体是企业本身，与员工是否在职无关，因此员工离职后企业仍需继续缴纳垃圾处理费。以下从不同角度展开说明：

1. 法律义务主体角度
   根据《固体废物污染环境防治法》及相关地方性法规，垃圾处理费的缴纳义务主体是产生垃圾的单位或个人（企业属于单位范畴）。企业作为独立法人，需对其经营活动中产生的垃圾承担处理责任，这一义务不因员工流动而转移。例如，某餐饮企业即使员工全部离职，仍需为门店产生的厨余垃圾缴纳处理费。

2. 费用性质角度
   垃圾处理费属于行政事业性收费，由地方政府根据企业垃圾产生量或经营规模核定征收。其本质是对企业占用公共环境资源的补偿，与员工人数无直接关联。例如，某制造企业按厂房面积缴纳垃圾处理费，员工离职不会改变厂房面积，故缴费义务不变。

3. 特殊情形说明
   若企业因员工离职导致经营规模显著缩小（如关闭部分门店），可向环卫部门申请重新核定缴费基数。但需提供经营变更证明（如注销营业执照、场地租赁合同解除等），且最终是否调整以行政机关认定为准。

建议：企业若遇到员工离职后垃圾处理费缴纳问题，可重点核查当地收费依据（如按人数/面积/产量计费），若因经营变动需调整费用，应及时与环卫部门沟通并留存书面证据。如有复杂情况，可进一步向我咨询具体操作流程。