结论：在对方醉酒驾驶电瓶车的情况下，您方的商业险能否拒赔，需根据具体情况判断，主要取决于保险合同中的免责条款以及电瓶车是否被认定为机动车等因素。以下从不同角度进行分析：
一、保险合同中的免责条款
若保险合同中明确约定醉酒驾驶为免责事由：
- 根据《中华人民共和国保险法》及相关保险条款，如果保险合同中明确将醉酒驾驶列为免责条款，且该条款在订立合同时已向投保人进行了明确说明，那么在对方醉酒驾驶电瓶车的情况下，保险公司有权依据该条款拒绝赔偿。
- 法律依据：《中华人民共和国保险法》第十七条：“订立保险合同，采用保险人提供的格式条款的，保险人向投保人提供的投保单应当附格式条款，保险人应当向投保人说明合同的内容。对保险合同中免除保险人责任的条款，保险人在订立合同时应当在投保单、保险单或者其他保险凭证上作出足以引起投保人注意的提示，并对该条款的内容以书面或者口头形式向投保人作出明确说明；未作提示或者明确说明的，该条款不产生效力。”
若保险合同中未明确约定醉酒驾驶为免责事由：
- 如果保险合同中并未将醉酒驾驶列为免责条款，或者该条款未向投保人进行明确说明，那么保险公司可能无法直接依据醉酒驾驶这一理由拒绝赔偿。
二、电瓶车的性质认定
电瓶车被认定为机动车：
- 如果电瓶车在事故发生时被依法认定为机动车，且对方醉酒驾驶该机动车，那么根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，醉酒驾驶机动车是违法行为，可能构成危险驾驶罪。在此情况下，如果保险合同中有相关免责条款，保险公司可能有权拒赔。
- 法律依据：《中华人民共和国道路交通安全法》第九十一条：“饮酒后驾驶机动车的，处暂扣六个月机动车驾驶证，并处一千元以上二千元以下罚款。因饮酒后驾驶机动车被处罚，再次饮酒后驾驶机动车的，处十日以下拘留，并处一千元以上二千元以下罚款，吊销机动车驾驶证。醉酒驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门约束至酒醒，吊销机动车驾驶证，依法追究刑事责任；五年内不得重新取得机动车驾驶证。”
电瓶车被认定为非机动车：
- 如果电瓶车在事故发生时被依法认定为非机动车，那么对方醉酒驾驶非机动车虽然可能违反交通法规，但不一定构成保险合同中的免责事由。此时，保险公司是否拒赔需依据保险合同的具体条款来判断。
三、实际操作建议
仔细审查保险合同：
- 首先，您需要仔细审查您方与保险公司签订的保险合同，特别是其中的免责条款部分，看是否有关于醉酒驾驶的明确约定。
收集证据：
- 收集与事故相关的所有证据，包括事故现场照片、交警出具的事故认定书、对方醉酒的证据（如血液酒精含量检测报告）等。
咨询专业律师：
- 如果您对保险合同条款的理解存在疑问，或者认为保险公司拒赔的理由不充分，建议咨询专业律师，以便更好地维护您的合法权益。不过在这里，你可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况和保险合同内容，为你提供更具体的法律建议。
与保险公司协商或诉讼：
- 在收集好证据并咨询专业律师后，您可以与保险公司进行协商，看是否能够达成赔偿协议。如果协商无果，您可以考虑通过法律途径解决争议，如提起民事诉讼。
总结：对方醉酒驾驶电瓶车时，您方的商业险能否拒赔需根据保险合同中的免责条款以及电瓶车的性质认定等因素来判断。建议您仔细审查保险合同、收集证据，并在必要时咨询专业律师以维护您的合法权益。