若案件因法定事由导致不能按期结案且已过去两年，需根据具体程序类型和阶段采取不同措施；若因人为拖延或程序瑕疵导致超期，可依法申请救济或提出异议。以下是具体分析：

1. 区分案件类型与程序阶段
   首先需明确案件性质（民事、刑事、行政）及所处程序阶段（一审、二审、执行等）。不同程序对审限的规定及超期处理方式存在差异：

   • 民事案件：根据《民事诉讼法》，一审普通程序审限为6个月，经院长批准可延长6个月；二审审限为3个月，有特殊情况需延长的报请上级法院批准。若因公告、鉴定、管辖权争议等法定事由中止审理，中止期间不计入审限。若案件已超法定审限且无合法中止事由，可向法院监察部门或上级法院反映，要求说明超期原因并督促结案。
     
   • 刑事案件：根据《刑事诉讼法》，一审公诉案件审限为2个月，至迟不超过3个月；可能判处死刑或附带民事诉讼等案件，经上级法院批准可延长3个月。二审审限为2个月。若因补充侦查、精神鉴定等法定事由中止审理，中止期间不计入审限。若超期无合法理由，可向检察院申请法律监督，要求检察院向法院提出纠正违法意见。
     
   • 行政案件：根据《行政诉讼法》，一审审限为6个月，二审审限为3个月。若因鉴定、管辖争议等法定事由中止审理，中止期间不计入审限。超期无合法理由的，可参照民事案件处理方式向法院或上级法院反映。
     

2. 核查超期原因与程序合法性
   若案件超期系因法定事由（如中止审理、延长审限批准等），需核查相关法律文书（如延长审限裁定书、中止审理裁定书）是否齐全且程序合法。若缺乏合法手续或手续存在瑕疵（如未按规定审批、未及时恢复审理等），可依法提出异议：

   • 向法院提出书面异议：要求法院说明超期原因及处理方案，并附相关法律依据（如《民事诉讼法》第149条、《刑事诉讼法》第208条等）。
     
   • 申请上级法院监督：若法院未回应或处理不当，可向上一级法院申请督促或提级审理，尤其涉及重大、疑难案件时，上级法院可能直接介入。
     

3. 考虑救济途径与权利主张
   若超期导致当事人权利受损（如财产保全过期、执行时机丧失等），可结合具体损失主张救济：

   • 民事案件：若因超期导致财产被转移或执行困难，可申请法院采取补救措施（如恢复执行、追加被执行人等），或通过另诉主张赔偿（需证明超期与损失的因果关系）。
     
   • 刑事案件：若因超期导致被告人长期羁押，可申请取保候审或变更强制措施；若已判决，可结合超期情节在申诉或抗诉中主张程序违法。
     
   • 行政案件：若因超期导致行政行为效力持续（如行政处罚未及时撤销），可申请法院确认行政行为违法或要求行政机关自行纠正。
     

4. 特殊情形：执行程序超期
   若案件已进入执行阶段且超期未结，需区分“执行不能”与“执行拖延”：

   • 执行不能：因被执行人无财产可供执行，法院可裁定终结本次执行程序，待发现财产后恢复执行。此时超期不构成违法，但当事人可申请参与分配或申请破产（如被执行人为企业）。
     
   • 执行拖延：若法院存在消极执行、选择性执行等行为，可向法院执行局或上级法院执行监督部门反映，或依据《民事诉讼法》第232条申请执行异议，要求更换执行人员或采取强制措施。
     

行动建议：

1. 携带案件材料（如起诉状、传票、裁定书等）至法院档案室调取完整卷宗，核查审限变更的合法性；
   
2. 书面整理超期时间线及法律依据，向法院立案庭或监察部门提交《审限监督申请书》；
   
3. 若涉及重大权益损失，可同步准备证据材料，考虑通过信访、媒体监督（需谨慎）或法律程序主张权利。
   

如有进一步细节（如案件类型、超期阶段、是否收到法院通知等），可向我补充说明，以便提供更精准的建议。