合作制个体工商户在我国是合法的，其法律依据主要来源于《中华人民共和国民法典》中关于个人合伙的相关规定。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》的相关规定：
- 根据《民法典》中关于个人合伙的条款，两个以上的公民按照协议，各自提供资金、实物、技术等，合伙经营、共同劳动，即构成个人合伙。这种合作形式在个体工商户中同样适用，只要符合相关法律规定，即可合法设立并运营。
个体工商户的登记管理规定：
- 个体工商户的设立、变更、注销等登记事项，需遵循《个体工商户登记管理办法》等相关规定。对于合作制的个体工商户，虽然其内部可能存在多个合伙人，但在工商登记时，通常仍以一个个体工商户的名义进行登记，并明确其经营形式和合伙人信息。
二、合作制个体工商户的特点
共同出资、共同经营：
- 合作制个体工商户的合伙人通常共同出资，共同参与经营决策，共享经营收益，并共担经营风险。这种合作模式有助于集合多方资源，提高经营效率和竞争力。
灵活性高：
- 相较于公司制企业，合作制个体工商户在设立、运营和解散等方面具有更高的灵活性。合伙人可以根据实际情况灵活调整合作方式、出资比例和利润分配等事项。
责任承担：
- 在合作制个体工商户中，合伙人通常对债务承担无限连带责任。这意味着，如果个体工商户的债务无法清偿，合伙人可能需要以其个人财产来承担债务责任。
三、设立与运营建议
签订书面合作协议：
- 为了明确各合伙人的权利和义务，避免未来可能出现的纠纷，建议合作制个体工商户的合伙人在设立时签订书面合作协议。协议中应详细约定出资方式、出资比例、利润分配、亏损承担、决策机制等关键条款。
遵守相关法律法规：
- 在设立和运营过程中，合作制个体工商户应严格遵守国家法律法规和政策规定，确保合法合规经营。特别是要关注税务、工商、劳动等方面的法律法规要求，避免因违规操作而面临法律风险。
建立完善的内部管理制度：
- 为了保障个体工商户的稳健运营，建议建立完善的内部管理制度，包括财务管理制度、人事管理制度、业务管理制度等。这些制度有助于规范合伙人的行为，提高经营效率和管理水平。
如果您在合作制个体工商户的设立或运营过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和解决方案。