当机动车驾驶人在交通事故中负全责时，保险公司是否会进行赔偿，这主要取决于交强险和三者险的保单条款以及事故的具体情况。以下是对这一问题的详细解答：
一、保险赔偿的基本原则
在交通事故中，赔偿通常遵循“交强险先行赔付，三者险补充赔偿”的原则。这意味着，首先由交强险在其赔偿限额内对受害人的人身伤亡和财产损失进行赔偿。若损失超出交强险的赔偿限额，且车辆投保了商业第三者责任险（即三者险），则保险公司将依据保单条款，在约定的责任限额内继续赔偿。
二、三者险的赔偿范围与条件
赔偿范围：三者险主要赔偿因交通事故导致的第三者人身伤亡和财产直接损毁的经济损失。这包括但不限于医疗费用、丧葬费用、死亡赔偿、残疾赔偿、辅助器具费用、护理费用、交通费用、被抚养人生活费、误工费用等。但需要注意的是，精神损害赔偿一般不在三者险的赔偿范围内，除非合同有特别约定。
赔偿条件：
三、免赔情况
在以下情况下，保险公司可能会拒绝赔付或部分赔付：
特定行为免赔：如酒驾、毒驾、无证驾驶、逃逸等违法行为导致的交通事故，保险公司将拒绝赔付。
免赔额扣除：部分保单设有免赔额，即保险公司不承担的小额损失部分。这通常为损失的固定比例（如20%）或固定金额。
四、司机全责时的特别注意事项
了解保险条款：在投保前，务必仔细阅读保险合同，明确保险责任、赔偿限额、免赔额及免责条款。
遵守交通规则：严格遵守交通法规，提高驾驶安全意识，是预防事故的根本。
及时报案与配合：事故发生后，应立即向保险公司报案，并保留好现场证据，如实陈述事故经过，积极配合保险公司调查。
赔偿超额处理：若事故损失超过保险限额，超出部分需由司机个人承担。因此，建议根据实际需要合理选择保险额度，以确保自身权益得到充分保障。
综上所述，当机动车驾驶人在交通事故中负全责时，保险公司会根据交强险和三者险的保单条款，在责任限额内对受害人进行赔偿。但具体赔偿金额、范围及是否免责，需综合考虑多种因素。因此，建议驾驶人在投保前充分了解保险内容，并在事故发生后按照正规流程处理，以确保自身权益得到最大保障。