合同用笔圈住重要的东西，这一行为本身并不违法。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

合同形式与内容合法性

1. 合同形式：合同的形式多种多样，包括书面形式、口头形式以及其他形式。书面形式合同中，用笔圈住重要内容，可以视为对合同条款的一种强调或标注，并不改变合同本身的书面性质。只要合同内容合法、双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，该合同就是有效的。

2. 合同内容：合同的内容由双方当事人约定，只要不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是合法的。用笔圈住重要内容，并不涉及合同内容的合法性判断，因此这一行为本身不会导致合同违法。

合同修改与变更

1. 修改方式：如果合同双方希望对合同内容进行修改，应当通过协商一致，并采用书面形式进行变更。用笔圈住重要内容，并不等同于对合同的修改或变更。如果双方没有就圈住的内容达成新的协议，那么这部分内容仍然按照原合同执行。

2. 法律效力：未经双方协商一致，单方面用笔圈住合同内容并试图改变原合同约定的，这种行为不具有法律效力。合同双方应当遵循原合同的约定，履行各自的义务。

实际操作建议

1. 明确标注目的：如果希望用笔圈住合同中的重要内容以引起对方注意或便于后续查阅，建议在标注时注明标注目的，并尽量保持标注的清晰和整洁，以免影响合同的阅读和理解。

2. 避免误解和纠纷：在标注重要内容时，应当确保标注不会改变原合同的意思表示，也不会引起对方的误解。如果标注内容可能引发争议，建议及时与对方沟通并达成一致意见。

3. 保留证据：如果合同双方对圈住的内容存在争议，建议保留好相关证据，如合同原件、标注的复印件或照片等，以便在需要时证明自己的主张。

总结来说，合同用笔圈住重要的东西，这一行为本身并不违法。但为了避免可能的误解和纠纷，建议在标注时明确标注目的、保持标注的清晰和整洁，并在必要时保留好相关证据。如果您在合同方面还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。