侵占集体资金5000元长达33个月，可能涉及民事侵权责任和刑事责任两种法律后果，具体处理方式需结合行为性质和证据情况判断，以下分情况说明：
一、若行为性质为民事侵权（如挪用资金但未达到刑事立案标准）
- 责任主体：直接侵占人需承担返还资金、赔偿损失等民事责任，集体组织（如村委会、合作社等）可作为原告起诉。
- 处理流程：
- 协商解决：集体组织可先与侵占人协商，要求其限期返还资金及孳息（如利息）；
- 民事诉讼：协商无果的，集体组织可向法院提起民事诉讼，主张返还资金、赔偿损失（如资金占用期间的利息损失）；
- 执行程序：若侵占人拒不履行判决，集体组织可申请法院强制执行，冻结其财产或采取其他执行措施。
- 法律依据：
- 《民法典》第122条（不当得利返还）、第179条（赔偿损失）；
- 《民事诉讼法》相关执行程序规定。
二、若行为性质为刑事犯罪（如职务侵占罪或挪用资金罪）
- 刑事立案标准：
- 职务侵占罪：根据《刑法》第271条，侵占公司、企业或其他单位财物，数额较大的（通常为6万元以上，但部分地区可能更低）构成犯罪。5000元未达刑事立案标准，但若存在多次侵占、情节恶劣等情形，可能被追诉；
- 挪用资金罪：根据《刑法》第272条，挪用单位资金归个人使用或借贷给他人，数额较大（通常为10万元以上）或超过3个月未还的构成犯罪。5000元未达数额标准，但若挪用时间长达33个月且未归还，可能被认定为“数额较大不退还”，从而构成犯罪。
- 处理流程：
- 刑事报案：集体组织可向公安机关报案，由公安机关立案侦查；
- 刑事诉讼：若公安机关立案，案件将进入刑事诉讼程序，由检察院审查起诉、法院审判；
- 刑事责任：若构成犯罪，侵占人可能面临有期徒刑、拘役或罚金等刑罚，同时需退赔资金。
- 法律依据：
- 《刑法》第271条（职务侵占罪）、第272条（挪用资金罪）；
- 《刑事诉讼法》相关立案、侦查、起诉、审判程序规定。
三、特殊情形：行为人身份影响定性
- 若侵占人为集体组织成员（如村民）且无职务便利：
- 通常按民事侵权处理，集体组织可通过民事诉讼追责；
- 若存在暴力、威胁等手段，可能涉及其他犯罪（如寻衅滋事罪），需另行分析。
- 若侵占人利用职务便利（如村干部、会计等）：
- 优先按职务侵占罪或挪用资金罪处理，即使数额未达标准，也可能因情节恶劣被追诉；
- 若同时存在贪污、受贿等行为，可能数罪并罚。
四、建议行动步骤
- 收集证据：保留资金流转记录（如转账凭证、收据）、侵占人承认侵占的书面或录音证据、集体组织决策文件等；
- 咨询律师：根据证据情况，由律师评估是否构成犯罪及诉讼策略；
- 选择途径：根据律师意见，选择协商、民事诉讼或刑事报案等途径；
- 跟进处理：若选择刑事报案，需配合公安机关调查；若选择民事诉讼，需按时出庭并主张权利。
如有进一步疑问或需具体法律帮助，可直接向我咨询，我将结合您的证据和当地司法实践提供详细解答。