针对您提出的“原来在基本农田挖虾池，三调后不是基本农田了该怎么处理”的问题，这是一个涉及地类认定和后续处理措施的复杂情况。以下是我根据自然资源部相关政策及实际案例，为您提供的详细解答：
一、地类认定的基本原则
根据自然资源部的相关通知和规定，地类认定应坚持实事求是、综合考虑合理性、合法性的原则。国土调查成果反映的是调查时点的国土利用现状，但相关管理工作还需要进一步比对以往调查、规划、审批、督察执法等管理信息，以确保地类认定的准确性和合理性。
二、三调后地类变化的处理
调查成果与实地现状不一致的处理：
- 如果发现国土调查成果与实地国土利用现状不一致，无论是调查时点后新发生变化的，还是“三调”或历年国土调查错漏的，均应及时通过年度国土变更调查更新或纠正调查成果，确保调查地类与实地现状保持一致。
涉及管理急需的情况：
- 对于涉及管理急需的地类变化，可通过日常变更机制报部“即报即审”，以加快处理速度，确保管理工作的顺利进行。
三、您具体情况的处理建议
核实三调成果：
- 首先，您需要核实“三调”成果中该地块的地类认定情况。如果“三调”确实将该地块从基本农田调整为其他地类（如坑塘水面等），那么这一变化是基于实地现状的认定。
了解调整原因和合法性：
- 接着，您需要了解该地块地类调整的具体原因和合法性。如果调整是基于合法的规划、审批或督察执法等管理信息，那么这一调整是有效的。但如果调整存在争议或不符合相关规定，您可以向相关部门提出异议或申请复核。
后续处理措施：
- 如果“三调”后该地块不再属于基本农田：
- 您需要确认该地块是否仍然属于农用地范畴。如果属于农用地，且您希望继续用于农业用途（如养殖虾等），您需要确保您的使用行为符合当地农业规划和环保要求。
- 如果该地块已经规划为其他用途（如建设用地等），您需要按照新的规划要求进行处理，可能需要停止养殖活动并恢复土地原状或进行其他合规的利用。
- 如果“三调”成果存在争议：
- 您可以向当地自然资源部门提出异议，并申请进行实地复核或举证。在复核或举证过程中，您需要提供相关证据材料以支持您的观点。
- 如果复核或举证结果支持您的观点，相关部门将及时更新调查成果并调整地类认定。
四、案例参考
以湖南永州市道县白马渡镇白马渡村村民孙小萍的案例为例，该案例中涉及“二调”、“三调”不同时期认定的不同地类以及永久基本农田的认定问题。最终，法院在判决时综合考虑了“三调”成果、土地利用现状、违法行为的性质及后果等因素，作出了合理的判决。这一案例表明，在地类认定存在争议时，法院会综合考虑多种因素来作出判决。
五、总结与建议
- 保持与当地自然资源部门的沟通：及时了解地类认定的最新政策和要求，确保您的使用行为符合相关规定。
- 关注土地利用规划的变化：如果土地利用规划发生变化，您需要及时调整您的使用计划以适应新的规划要求。
- 依法合规使用土地：无论地块地类如何变化，您都需要确保您的使用行为符合法律法规的要求，避免因违法使用土地而面临法律责任。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时与我联系。