违反罚缴分离的处理方式需根据具体违法情形及主体身份分情况讨论，核心结论如下：

1. 对行政机关的处理

   • 责令改正+内部追责：若行政机关未严格执行罚缴分离（如执法人员直接收取罚款未上缴国库），根据《行政处罚法》第七十条，由上级行政机关或有关部门责令改正，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分（如警告、记过、降级等）。
     
   • 财政返还限制：根据《罚款决定与罚款收缴分离实施办法》，罚款必须通过指定银行缴纳至国库，行政机关不得截留、私分或变相返还。若存在此类行为，除追责外，违法所得需依法追缴。
     

2. 对执法人员的处理

   • 行政处分：执法人员若违反罚缴分离规定（如私自收取罚款、未开具合法票据），依据《公务员法》或《行政机关公务员处分条例》，可能面临警告、记过、记大过、降级、撤职甚至开除处分。
     
   • 刑事责任：若执法人员利用职务便利，将罚款据为己有或挪作他用，可能涉嫌贪污罪或挪用公款罪，需依法追究刑事责任。
     

3. 对当事人的权利救济

   • 投诉举报：当事人若发现行政机关或执法人员违反罚缴分离，可向其上级机关、财政部门或纪检监察机关投诉举报，要求核查处理。
     
   • 行政复议/诉讼：若因违反罚缴分离导致当事人权益受损（如重复缴纳罚款、罚款未上缴导致无法申请强制执行），可依法申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销违法处罚决定或赔偿损失。
     

关键法律依据：

• 《行政处罚法》第七十条（行政机关责任）、第六十七条（罚缴分离原则）
  
• 《罚款决定与罚款收缴分离实施办法》第四条（罚款缴纳方式）
  
• 《刑法》第三百八十二条（贪污罪）、第三百八十四条（挪用公款罪）
  

建议：若您遇到具体案件中行政机关或执法人员违反罚缴分离，可提供详细情况（如处罚主体、违法情形、证据材料等），我将进一步分析法律风险及维权路径。