在一般情况下，小车红灯停下来，后面摩托车撞上来追尾摔倒，摩托车通常要承担主要或全部责任。不过，具体责任划分还需根据事故现场的具体情况和双方车辆的行驶状态等因素进行综合判定。以下是对此问题的详细分析：
一、基本责任原则
根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第九十一条，公安机关交通管理部门应根据交通事故当事人的行为对发生交通事故所起的作用以及过错的严重程度，确定当事人的责任。在摩托车追尾小车的事故中，若小车正常停车等待红灯，摩托车因未保持安全距离、车速过快、注意力不集中等原因导致追尾，摩托车一般要承担主要或全部责任。
二、特殊情形考虑
小车存在违法行为：若小车在停车等待红灯时存在诸如突然刹车、违规停车（如停在非机动车道或影响其他车辆通行的位置）等违法行为，且这些行为影响到摩托车正常行驶导致追尾，小车可能要承担一定责任。但这种情况较为少见，且需有充分证据证明小车的违法行为与事故发生有直接因果关系。
摩托车存在特殊情况：若摩托车因突发疾病、机械故障等不可抗力因素导致无法及时刹车而追尾，且摩托车驾驶人已尽到合理注意义务，那么责任划分可能会更加复杂。但这种情况同样需要充分证据支持，且通常摩托车仍需承担一定责任，只是可能减轻其责任比例。
三、事故处理流程
立即停车并保护现场：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十条，车辆驾驶人应当立即停车，保护现场；造成人身伤亡的，应当立即抢救受伤人员，并迅速报告执勤的交通警察或者公安机关交通管理部门。
报警与等待处理：不即行撤离现场的，应当迅速报告执勤的交通警察或者公安机关交通管理部门。交警会根据现场勘查、调查和相关检验鉴定，及时制作事故认定书。
协商赔偿或诉讼：根据责任认定，双方可以协商赔偿或通过调解、诉讼解决纠纷。若双方对事故责任无争议，且未造成人身伤亡，也可以即行撤离现场，恢复交通，自行协商处理损害赔偿事宜。
四、赔偿与保险理赔
赔偿责任：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足的部分，按照各自过错的比例分担责任。
保险理赔：事故发生后，应及时通知保险公司进行理赔。保险公司会根据事故责任认定书和保险合同条款进行赔付。若摩托车驾驶人投保了交强险和商业三者险，且保险条款涵盖此类事故赔偿，则保险公司应在保险责任限额内承担赔偿责任。
总结与建议：
在摩托车追尾小车的事故中，摩托车通常要承担主要或全部责任。但具体责任划分还需根据事故现场的具体情况和双方车辆的行驶状态等因素进行综合判定。因此，在处理此类事故时，建议双方保持冷静，及时报警并保护现场，等待交警到来进行勘查和调查。同时，双方也可以协商赔偿或通过法律途径解决纠纷。若您对此类事故处理有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。