与员工签订保密协议，用人单位在一般情况下无需支付额外的保密费，但特定情况下需按约支付相应费用。以下是对这一问题的详细分析：

一、仅承担保密义务的情况

保密义务是员工基于劳动合同或相关协议而承担的法定义务。员工在工作过程中知悉的用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项，本身就负有保密的责任。例如，员工接触到的公司产品配方、客户名单等，即使未约定保密费，也不得随意泄露，否则将构成侵权。因此，在仅要求员工承担保密义务的情况下，用人单位无需支付保密费。

二、签订竞业限制协议的情况

当用人单位与员工签订了竞业限制协议，约定员工在离职后一定期限内不得从事与本单位有竞争关系的工作时，用人单位需向员工支付经济补偿（可视为一种广义的“保密费”）。根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条的规定，对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或保密协议中约定竞业限制条款，并约定在解除或终止劳动合同后，按月给予劳动者经济补偿。若用人单位未依法支付，员工有权依法维护自身权益。因此，在签订竞业限制协议的情况下，用人单位需按约支付经济补偿。

三、特别约定的情况

如果双方保密协议中有特别约定，明确用人单位在员工保守秘密期间需要支付一定费用，那么用人单位应当按照约定支付保密费。这是双方自愿协商的结果，具有法律效力。在存在特别约定的情况下，用人单位需依约支付保密费。

四、保密协议的签订与条款

用人单位为确保员工履行保密义务，可以与员工签订专门的保密协议，明确保密的内容、范围、期限以及违约责任等条款。但需要注意的是，保密协议中不得约定员工需要支付保密费，且用人单位应确保所支付的仅为正常的工资和福利待遇，而非额外的保密费用。保密协议的签订应合法合规，避免损害员工的合法权益。

五、实践建议

1. 明确保密义务与责任：在签订保密协议时，公司应明确劳动者的保密义务和责任，包括保密信息的范围、保密期限、违约责任等。
2. 合理设定保密措施：公司可以采取合理的保密措施，如设置访问权限、加密存储等，以确保保密信息的安全。
3. 考虑支付保密津贴（非必需）：虽然法律未要求支付保密费，但公司可以根据实际情况和需要，选择向承担较多保密义务的员工支付一定的保密津贴，以作为对其履行保密义务的额外激励。但这并非法定要求，而是公司的自主决定。

总结来说，与员工签订保密协议时，用人单位在一般情况下无需支付保密费。但在签订竞业限制协议或有特别约定的情况下，用人单位需按约支付相应费用。如有任何具体疑问或争议，可以直接向我咨询，我会为你提供更准确的法律意见。