在建设工程施工合同纠纷中，关于发包方反诉的时效问题，这实际上与一般的民事诉讼时效规定紧密相关。以下是对此问题的详细解答：
一、一般诉讼时效期间
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这一规定同样适用于建设工程施工合同纠纷中的发包方反诉情况。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
二、诉讼时效的起算点
约定付款或履行期限的情况：
- 若合同中明确规定了发包方或承包方应履行某项义务（如支付工程款）的具体时间，而一方未按时履行，则诉讼时效从约定的履行期限届满之次日起计算。例如，若合同约定工程竣工后发包方应在一定期限内支付结算款，若发包方未按时支付，则诉讼时效从该期限届满之次日开始计算。
未约定付款或履行期限的情况：
- 在此情形下，权利方可随时要求义务方履行，但需给予对方合理的准备时间。若权利方首次向义务方主张权利时，义务方明确表示拒绝履行，则诉讼时效从义务方拒绝履行的明确表示之日起开始计算。
三、诉讼时效的中止与中断
诉讼时效中止：
- 在诉讼时效期间的最后六个月内，若因不可抗力、无民事行为能力人或限制民事行为能力人无法定代理人等法定障碍导致无法行使请求权，诉讼时效将中止。中止时效的原因消除后，再经过六个月，诉讼时效期间届满。
诉讼时效中断：
- 诉讼时效可因提起诉讼、当事人一方提出要求（如发送催款函、反诉请求等）或同意履行义务而中断。一旦中断，诉讼时效期间将重新计算，即从中断时起再次开始三年的诉讼时效期间。对于发包方而言，如果其在诉讼过程中提出反诉，这一行为本身即构成诉讼时效的中断，反诉的诉讼时效将从提出反诉之日起重新计算。
四、最长权利保护期间
- 自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。但有特殊情况的，人民法院可根据权利人申请决定延长。
五、实际操作建议
- 及时咨询专业律师：鉴于建设工程施工合同纠纷的复杂性及诉讼时效规定的严谨性，建议发包方或承包方在发现对方违约或自身权益受损后，及时咨询专业律师以准确确定诉讼时效的起算点、是否存在中止或中断的事由，并采取有效措施保护自身权益。
- 保留相关证据：注意保留与纠纷相关的所有证据，包括合同、付款记录、沟通记录等，以便在诉讼时效期内有效维权。
- 积极行动维护权益：在诉讼时效期内，通过协商、催款、提起诉讼或反诉等方式积极维护自身权益，避免因时效问题而丧失胜诉权。
综上所述，建设工程施工合同纠纷中发包方反诉的时效问题需遵循一般的民事诉讼时效规定，同时考虑特定情况下的中止、中断和最长权利保护期间。在实际操作中，建议结合具体案情和法律规定，寻求专业律师的帮助和指导。