合同约定了仲裁条款后，原则上当事人应通过仲裁解决纠纷，不能直接向法院起诉，但在特定法定情形下，当事人可以向法院提起诉讼。以下是对此问题的详细分析：

一、仲裁条款的效力与原则

根据《中华人民共和国仲裁法》第五条，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。这表明，有效的仲裁协议具有排除法院管辖权的效力。仲裁和诉讼是两种相互排斥的争议解决方式，一旦合同双方选择了仲裁，就意味着放弃了通过法院诉讼的权利。

二、仲裁协议无效的情形

尽管仲裁协议具有排除法院管辖权的效力，但在以下特定情形下，仲裁协议可能无效，此时当事人可以向法院提起诉讼：

1. 约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围：例如，涉及婚姻、收养、监护、抚养、继承等纠纷，这些事项依法不得仲裁。
2. 无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议：此类协议因主体资格问题而无效。
3. 一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议：此类协议因缺乏自愿性而无效。
4. 仲裁协议对仲裁事项或者仲裁委员会没有约定或者约定不明确，且当事人未能达成补充协议：根据《中华人民共和国仲裁法》第十八条，此时仲裁协议无效。

三、放弃仲裁协议的情形

如果一方向法院起诉时，没有向法院声明双方存在仲裁协议，而另一方在首次开庭前也未对法院受理该案提出异议，那么这将被视为双方放弃了仲裁协议。此时，法院可以继续审理该案。

四、仲裁裁决的撤销或不予执行

仲裁裁决作出后，并非终局。当事人如果认为仲裁裁决存在错误或违反法律规定等情况，可以向法院申请撤销或不予执行仲裁裁决。若法院裁定撤销或不予执行仲裁裁决，当事人可以就同一纠纷向人民法院提起诉讼。

五、实际操作建议

1. 审查仲裁协议的有效性：在处理涉及仲裁协议的纠纷时，当事人应首先审查仲裁协议的有效性。若仲裁协议有效，则应依约通过仲裁解决纠纷。
2. 考虑特殊情形：若仲裁协议无效或存在其他特定情形（如放弃仲裁协议、仲裁裁决被撤销或不予执行等），则可以考虑向法院提起诉讼。
3. 保留相关证据和材料：无论选择仲裁还是诉讼，当事人都应保留好相关证据和材料，以便在必要时证明自己的权益。

示例说明：假设甲乙双方在合同中约定了仲裁条款，但后续因合同履行发生争议。若仲裁条款有效，则甲乙双方应通过仲裁解决纠纷；若仲裁条款因约定不明确而无效，且双方未能达成补充协议，则甲乙双方可以向法院提起诉讼。

总结来说，合同约定了仲裁条款后，当事人应遵守仲裁协议的约定，通过仲裁解决纠纷。但在特定法定情形下，如仲裁条款无效、双方放弃仲裁协议或仲裁裁决被撤销或不予执行时，当事人仍有向法院提起诉讼的权利。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。